RALGDS

RALGDS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1RAX, 2B3A, 2RGF, 3KH0
Ідентифікатори
Символи	RALGDS, RGDS, RGF, RalGEF, ral guanine nucleotide dissociation stimulator
Зовнішні ІД	OMIM: 601619 MGI: 107485 HomoloGene: 4562 GeneCards: RALGDS
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0005083 GTPase regulator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • brush border • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • small GTPase mediated signal transduction • Ras protein signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0048552 regulation of catalytic activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5900	19730
Ensembl	ENSG00000160271	ENSMUSG00000026821
UniProt	Q12967	Q03385
RefSeq (мРНК)	NM_006266 NM_001042368 NM_001271774 NM_001271775 NM_001271776	NM_001145834 NM_001145835 NM_001145836 NM_009058
RefSeq (білок)	NP_001035827 NP_001258703 NP_001258704 NP_001258705 NP_006257	NP_001139306 NP_001139307 NP_001139308 NP_033084
Локус (UCSC)	Хр. 9: 133.1 – 133.15 Mb	Хр. 2: 28.4 – 28.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RALGDS (англ. Ral guanine nucleotide dissociation stimulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 914 амінокислот, а молекулярна маса — 100 607.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVQRMWAEAA		GPAGGAEPLF		PGSRRSRSVW		DAVRLEVGVP		DSCPVVLHSF
TQLDPDLPRP		ESSTQEIGEE		LINGVIYSIS		LRKVQLHHGG		NKGQRWLGYE
NESALNLYET		CKVRTVKAGT		LEKLVEHLVP		AFQGSDLSYV		TIFLCTYRAF
TTTQQVLDLL		FKRYGRCDAL		TASSRYGCIL		PYSDEDGGPQ		DQLKNAISSI
LGTWLDQYSE		DFCQPPDFPC		LKQLVAYVQL		NMPGSDLERR		AHLLLAQLEH
SEPIEAEPEA		LSPVPALKPT		PELELALTPA		RAPSPVPAPA		PEPEPAPTPA
PGSELEVAPA		PAPELQQAPE		PAVGLESAPA		PALELEPAPE		QDPAPSQTLE
LEPAPAPVPS		LQPSWPSPVV		AENGLSEEKP		HLLVFPPDLV		AEQFTLMDAE
LFKKVVPYHC		LGSIWSQRDK		KGKEHLAPTI		RATVTQFNSV		ANCVITTCLG
NRSTKAPDRA		RVVEHWIEVA		RECRILKNFS		SLYAILSALQ		SNSIHRLKKT
WEDVSRDSFR		IFQKLSEIFS		DENNYSLSRE		LLIKEGTSKF		ATLEMNPKRA
QKRPKETGII		QGTVPYLGTF		LTDLVMLDTA		MKDYLYGRLI		NFEKRRKEFE
VIAQIKLLQS		ACNNYSIAPD		EQFGAWFRAV		ERLSETESYN		LSCELEPPSE
SASNTLRTKK		NTAIVKRWSD		RQAPSTELST		SGSSHSKSCD		QLRCGPYLSS
GDIADALSVH		SAGSSSSDVE		EINISFVPES		PDGQEKKFWE		SASQSSPETS
GISSASSSTS		SSSASTTPVA		ATRTHKRSVS		GLCNSSSALP		LYNQQVGDCC
IIRVSLDVDN		GNMYKSILVT		SQDKAPAVIR		KAMDKHNLEE		EEPEDYELLQ
ILSDDRKLKI		PENANVFYAM		NSTANYDFVL		KKRTFTKGVK		VKHGASSTLP
RMKQKGLKIA		KGIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Hofer F., Fields S., Schneider C., Martin G.S. (1994). Activated Ras interacts with the Ral guanine nucleotide dissociation stimulator. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 11089—11093. PMID 7972015 DOI:10.1073/pnas.91.23.11089
• Geyer M., Herrmann C., Wohlgemuth S., Wittinghofer A., Kalbitzer H.R. (1997). Structure of the Ras-binding domain of RalGEF and implications for Ras binding and signalling. Nat. Struct. Biol. 4: 694—699. PMID 9302994 DOI:10.1038/nsb0997-694

Див. також

• Хромосома 9