RANBP2

RANBP2
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1RRP, 1XKE, 1Z5S, 3UIN, 3UIO, 3UIP, 4I9Y, 4L6E, 4LQW, 5CLL, 5CLQ, 2LAS
Ідентифікатори
Символи	RANBP2, ADANE, ANE1, IIAE3, NUP358, TRP1, TRP2, RAN binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601181 HomoloGene: 136803 GeneCards: RANBP2
Онтологія гена Молекулярна функція • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • зв'язування з іоном металу • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • SUMO transferase activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • cyclosporin A binding • transferase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • Ядерна мембрана • мембрана • Ядерна пора • nuclear inclusion body • nuclear pore nuclear basket • клітинне ядро • nuclear envelope • lamellae anulatae • внутрішньоклітинна мембранна органела • цитоплазма • центросома • мітохондрія • nuclear pore cytoplasmic filaments • cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex • host cell Біологічний процес • mRNA transport • viral transcription • intracellular transport • protein sumoylation • protein peptidyl-prolyl isomerization • mitotic nuclear membrane disassembly • згортання білків • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • NLS-bearing protein import into nucleus • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • centrosome localization • G1 phase • RNA export from nucleus • ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0043146 spindle organization • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of mitotic centrosome separation • response to amphetamine • positive regulation of glucokinase activity • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • regulation of gluconeogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5903	н/д
Ensembl	ENSG00000153201	н/д
UniProt	P49792	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_006267	н/д
RefSeq (білок)	NP_006258	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 108.72 – 108.79 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

RANBP2 (англ. RAN binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 224 амінокислот, а молекулярна маса — 358 199.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRSKADVER		YIASVQGSTP		SPRQKSMKGF		YFAKLYYEAK		EYDLAKKYIC
TYINVQERDP		KAHRFLGLLY		ELEENTDKAV		ECYRRSVELN		PTQKDLVLKI
AELLCKNDVT		DGRAKYWLER		AAKLFPGSPA		IYKLKEQLLD		CEGEDGWNKL
FDLIQSELYV		RPDDVHVNIR		LVEVYRSTKR		LKDAVAHCHE		AERNIALRSS
LEWNSCVVQT		LKEYLESLQC		LESDKSDWRA		TNTDLLLAYA		NLMLLTLSTR
DVQESRELLQ		SFDSALQSVK		SLGGNDELSA		TFLEMKGHFY		MHAGSLLLKM
GQHSSNVQWR		ALSELAALCY		LIAFQVPRPK		IKLIKGEAGQ		NLLEMMACDR
LSQSGHMLLN		LSRGKQDFLK		EIVETFANKS		GQSALYDALF		SSQSPKDTSF
LGSDDIGNID		VREPELEDLT		RYDVGAIRAH		NGSLQHLTWL		GLQWNSLPAL
PGIRKWLKQL		FHHLPHETSR		LETNAPESIC		ILDLEVFLLG		VVYTSHLQLK
EKCNSHHSSY		QPLCLPLPVC		KQLCTERQKS		WWDAVCTLIH		RKAVPGNVAK
LRLLVQHEIN		TLRAQEKHGL		QPALLVHWAE		CLQKTGSGLN		SFYDQREYIG
RSVHYWKKVL		PLLKIIKKKN		SIPEPIDPLF		KHFHSVDIQA		SEIVEYEEDA
HITFAILDAV		NGNIEDAVTA		FESIKSVVSY		WNLALIFHRK		AEDIENDALS
PEEQEECKNY		LRKTRDYLIK		IIDDSDSNLS		VVKKLPVPLE		SVKEMLNSVM
QELEDYSEGG		PLYKNGSLRN		ADSEIKHSTP		SPTRYSLSPS		KSYKYSPKTP
PRWAEDQNSL		LKMICQQVEA		IKKEMQELKL		NSSNSASPHR		WPTENYGPDS
VPDGYQGSQT		FHGAPLTVAT		TGPSVYYSQS		PAYNSQYLLR		PAANVTPTKG
PVYGMNRLPP		QQHIYAYPQQ		MHTPPVQSSS		ACMFSQEMYG		PPALRFESPA
TGILSPRGDD		YFNYNVQQTS		TNPPLPEPGY		FTKPPIAAHA		SRSAESKTIE
FGKTNFVQPM		PGEGLRPSLP		TQAHTTQPTP		FKFNSNFKSN		DGDFTFSSPQ
VVTQPPPAAY		SNSESLLGLL		TSDKPLQGDG		YSGAKPIPGG		QTIGPRNTFN
FGSKNVSGIS		FTENMGSSQQ		KNSGFRRSDD		MFTFHGPGKS		VFGTPTLETA
NKNHETDGGS		AHGDDDDDGP		HFEPVVPLPD		KIEVKTGEED		EEEFFCNRAK
LFRFDVESKE		WKERGIGNVK		ILRHKTSGKI		RLLMRREQVL		KICANHYISP
DMKLTPNAGS		DRSFVWHALD		YADELPKPEQ		LAIRFKTPEE		AALFKCKFEE
AQSILKAPGT		NVAMASNQAV		RIVKEPTSHD		NKDICKSDAG		NLNFEFQVAK
KEGSWWHCNS		CSLKNASTAK		KCVSCQNLNP		SNKELVGPPL		AETVFTPKTS
PENVQDRFAL		VTPKKEGHWD		CSICLVRNEP		TVSRCIACQN		TKSANKSGSS
FVHQASFKFG		QGDLPKPINS		DFRSVFSTKE		GQWDCSACLV		QNEGSSTKCA
ACQNPRKQSL		PATSIPTPAS		FKFGTSETSK		TLKSGFEDMF		AKKEGQWDCS
SCLVRNEANA		TRCVACQNPD		KPSPSTSVPA		PASFKFGTSE		TSKAPKSGFE
GMFTKKEGQW		DCSVCLVRNE		ASATKCIACQ		NPGKQNQTTS		AVSTPASSET
SKAPKSGFEG		MFTKKEGQWD		CSVCLVRNEA		SATKCIACQN		PGKQNQTTSA
VSTPASSETS		KAPKSGFEGM		FTKKEGQWDC		SVCLVRNEAS		ATKCIACQCP
SKQNQTTAIS		TPASSEISKA		PKSGFEGMFI		RKGQWDCSVC		CVQNESSSLK
CVACDASKPT		HKPIAEAPSA		FTLGSEMKLH		DSSGSQVGTG		FKSNFSEKAS
KFGNTEQGFK		FGHVDQENSP		SFMFQGSSNT		EFKSTKEGFS		IPVSADGFKF
GISEPGNQEK		KSEKPLENGT		GFQAQDISGQ		KNGRGVIFGQ		TSSTFTFADL
AKSTSGEGFQ		FGKKDPNFKG		FSGAGEKLFS		SQYGKMANKA		NTSGDFEKDD
DAYKTEDSDD		IHFEPVVQMP		EKVELVTGEE		DEKVLYSQRV		KLFRFDAEVS
QWKERGLGNL		KILKNEVNGK		LRMLMRREQV		LKVCANHWIT		TTMNLKPLSG
SDRAWMWLAS		DFSDGDAKLE		QLAAKFKTPE		LAEEFKQKFE		ECQRLLLDIP
LQTPHKLVDT		GRAAKLIQRA		EEMKSGLKDF		KTFLTNDQTK		VTEEENKGSG
TGAAGASDTT		IKPNPENTGP		TLEWDNYDLR		EDALDDSVSS		SSVHASPLAS
SPVRKNLFRF		GESTTGFNFS		FKSALSPSKS		PAKLNQSGTS		VGTDEESDVT
QEEERDGQYF		EPVVPLPDLV		EVSSGEENEQ		VVFSHRAKLY		RYDKDVGQWK
ERGIGDIKIL		QNYDNKQVRI		VMRRDQVLKL		CANHRITPDM		TLQNMKGTER
VWLWTACDFA		DGERKVEHLA		VRFKLQDVAD		SFKKIFDEAK		TAQEKDSLIT
PHVSRSSTPR		ESPCGKIAVA		VLEETTRERT		DVIQGDDVAD		ATSEVEVSST
SETTPKAVVS		PPKFVFGSES		VKSIFSSEKS		KPFAFGNSSA		TGSLFGFSFN
APLKSNNSET		SSVAQSGSES		KVEPKKCELS		KNSDIEQSSD		SKVKNLFASF
PTEESSINYT		FKTPEKAKEK		KKPEDSPSDD		DVLIVYELTP		TAEQKALATK
LKLPPTFFCY		KNRPDYVSEE		EEDDEDFETA		VKKLNGKLYL		DGSEKCRPLE
ENTADNEKEC		IIVWEKKPTV		EEKAKADTLK		LPPTFFCGVC		SDTDEDNGNG
EDFQSELQKV		QEAQKSQTEE		ITSTTDSVYT		GGTEVMVPSF		CKSEEPDSIT
KSISSPSVSS		ETMDKPVDLS		TRKEIDTDST		SQGESKIVSF		GFGSSTGLSF
ADLASSNSGD		FAFGSKDKNF		QWANTGAAVF		GTQSVGTQSA		GKVGEDEDGS
DEEVVHNEDI		HFEPIVSLPE		VEVKSGEEDE		EILFKERAKL		YRWDRDVSQW
KERGVGDIKI		LWHTMKNYYR		ILMRRDQVFK		VCANHVITKT		MELKPLNVSN
NALVWTASDY		ADGEAKVEQL		AVRFKTKEVA		DCFKKTFEEC		QQNLMKLQKG
HVSLAAELSK		ETNPVVFFDV		CADGEPLGRI		TMELFSNIVP		RTAENFRALC
TGEKGFGFKN		SIFHRVIPDF		VCQGGDITKH		DGTGGQSIYG		DKFEDENFDV
KHTGPGLLSM		ANQGQNTNNS		QFVITLKKAE		HLDFKHVVFG		FVKDGMDTVK
KIESFGSPKG		SVCRRITITE		CGQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• Wu J., Matunis M.J., Kraemer D., Blobel G., Coutavas E. (1995). Nup358, a cytoplasmically exposed nucleoporin with peptide repeats, Ran-GTP binding sites, zinc fingers, a cyclophilin A homologous domain, and a leucine-rich region. J. Biol. Chem. 270: 14209—14213. PMID 7775481 DOI:10.1074/jbc.270.23.14209
• Beddow A.L., Richards S.A., Orem N.R., Macara I.G. (1995). The Ran/TC4 GTPase-binding domain: identification by expression cloning and characterization of a conserved sequence motif. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 3328—3332. PMID 7724562 DOI:10.1073/pnas.92.8.3328
• Pichler A., Gast A., Seeler J.S., Dejean A., Melchior F. (2002). The nucleoporin RanBP2 has SUMO1 E3 ligase activity. Cell. 108: 109—120. PMID 11792325 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00633-X
• Frosst P., Guan T., Subauste C., Hahn K., Gerace L. (2002). Tpr is localized within the nuclear basket of the pore complex and has a role in nuclear protein export. J. Cell Biol. 156: 617—630. PMID 11839768 DOI:10.1083/jcb.200106046
• Pichler A., Knipscheer P., Saitoh H., Sixma T.K., Melchior F. (2004). The RanBP2 SUMO E3 ligase is neither HECT- nor RING-type. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 984—991. PMID 15378033 DOI:10.1038/nsmb834
• Song J., Durrin L.K., Wilkinson T.A., Krontiris T.G., Chen Y. (2004). Identification of a SUMO-binding motif that recognizes SUMO-modified proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 14373—14378. PMID 15388847 DOI:10.1073/pnas.0403498101

Див. також

• Хромосома 2