RANGAP1

RANGAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Z5S, 2GRN, 2GRO, 2GRP, 2GRQ, 2GRR, 2IY0, 3UIN, 3UIO, 3UIP, 5D2M, 2IO2, 2IO3
Ідентифікатори
Символи	RANGAP1, Fug1, RANGAP, SD, Ran GTPase activating protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602362 MGI: 103071 HomoloGene: 55700 GeneCards: RANGAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • RNA binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex • ядерна пора • хромосома • дендрит (нейробіологія) • nuclear pore cytoplasmic filaments • mitotic spindle • центромера • цитоскелет • клітинне ядро • кінетохор • axon cytoplasm • цитоплазма • гіалоплазма • aggresome • perinuclear region of cytoplasm • nuclear envelope • нуклеоплазма • веретено поділу • ядерна мембрана Біологічний процес • cellular response to vasopressin • protein sumoylation • cellular response to peptide hormone stimulus • negative regulation of protein export from nucleus • response to axon injury • GO:0072468 сигнальна трансдукція • sister chromatid cohesion • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5905	19387
Ensembl	ENSG00000100401	ENSMUSG00000022391
UniProt	P46060	P46061
RefSeq (мРНК)	NM_001278651 NM_002883 NM_001317930	NM_001146174 NM_011241 NM_001358622
RefSeq (білок)	NP_001265580 NP_001304859 NP_002874	NP_001139646 NP_035371 NP_001345551
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.24 – 41.29 Mb	Хр. 15: 81.59 – 81.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RANGAP1 (англ. Ran GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 587 амінокислот, а молекулярна маса — 63 542.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASEDIAKLA		ETLAKTQVAG		GQLSFKGKSL		KLNTAEDAKD		VIKEIEDFDS
LEALRLEGNT		VGVEAARVIA		KALEKKSELK		RCHWSDMFTG		RLRTEIPPAL
ISLGEGLITA		GAQLVELDLS		DNAFGPDGVQ		GFEALLKSSA		CFTLQELKLN
NCGMGIGGGK		ILAAALTECH		RKSSAQGKPL		ALKVFVAGRN		RLENDGATAL
AEAFRVIGTL		EEVHMPQNGI		NHPGITALAQ		AFAVNPLLRV		INLNDNTFTE
KGAVAMAETL		KTLRQVEVIN		FGDCLVRSKG		AVAIADAIRG		GLPKLKELNL
SFCEIKRDAA		LAVAEAMADK		AELEKLDLNG		NTLGEEGCEQ		LQEVLEGFNM
AKVLASLSDD		EDEEEEEEGE		EEEEEAEEEE		EEDEEEEEEE		EEEEEEEPQQ
RGQGEKSATP		SRKILDPNTG		EPAPVLSSPP		PADVSTFLAF		PSPEKLLRLG
PKSSVLIAQQ		TDTSDPEKVV		SAFLKVSSVF		KDEATVRMAV		QDAVDALMQK
AFNSSSFNSN		TFLTRLLVHM		GLLKSEDKVK		AIANLYGPLM		ALNHMVQQDY
FPKALAPLLL		AFVTKPNSAL		ESCSFARHSL		LQTLYKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

• Bischoff F.R., Krebber H., Kempf T., Hermes I., Ponstingl H. (1995). Human RanGTPase-activating protein RanGAP1 is a homologue of yeast Rna1p involved in mRNA processing and transport. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 1749—1753. PMID 7878053 DOI:10.1073/pnas.92.5.1749
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Krebber H., Ponstingl H. (1996). Ubiquitous expression and testis-specific alternative polyadenylation of mRNA for the human Ran GTPase activator RanGAP1. Gene. 180: 7—11. PMID 8973340 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00389-7
• Joseph J., Tan S.-H., Karpova T.S., McNally J.G., Dasso M. (2002). SUMO-1 targets RanGAP1 to kinetochores and mitotic spindles. J. Cell Biol. 156: 595—602. PMID 11854305 DOI:10.1083/jcb.200110109
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 22