RAPGEF3

RAPGEF3
Ідентифікатори
Символи	RAPGEF3, CAMP-GEFI, EPAC, EPAC1, HSU79275, bcm910, Rap guanine nucleotide exchange factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606057 MGI: 2441741 HomoloGene: 21231 GeneCards: RAPGEF3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein domain specific binding • cAMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • Філоподія • Мікроворсинки • cortical actin cytoskeleton • екзосома • система ендомембран • lamellipodium • внутрішньоклітинний • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • establishment of endothelial barrier • regulation of actin cytoskeleton reorganization • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of insulin secretion • small GTPase mediated signal transduction • Rap protein signal transduction • positive regulation of syncytium formation by plasma membrane fusion • regulation of histone H3-K9 acetylation • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of protein acetylation • positive regulation of protein export from nucleus • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • Ангіогенез • проліферація • cAMP-mediated signaling • positive regulation of stress fiber assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to cAMP • negative regulation of syncytium formation by plasma membrane fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10411	223864
Ensembl	ENSG00000079337	ENSMUSG00000022469
UniProt	O95398	Q8VCC8
RefSeq (мРНК)	NM_001098531 NM_001098532 NM_006105	NM_001177810 NM_001177811 NM_144850 NM_001357630
RefSeq (білок)	NP_001092001 NP_001092002 NP_006096	NP_001171281 NP_001171282 NP_659099 NP_001344559
Локус (UCSC)	Хр. 12: 47.73 – 47.77 Mb	Хр. 15: 97.74 – 97.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAPGEF3 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 923 амінокислот, а молекулярна маса — 103 751.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVGWPGESC		WQVGLAVEDS		PALGAPRVGA		LPDVVPEGTL		LNMVLRRMHR
PRSCSYQLLL		EHQRPSCIQG		LRWTPLTNSE		ESLDFSESLE		QASTERVLRA
GRQLHRHLLA		TCPNLIRDRK		YHLRLYRQCC		SGRELVDGIL		ALGLGVHSRS
QVVGICQVLL		DEGALCHVKH		DWAFQDRDAQ		FYRFPGPEPE		PVRTHEMEEE
LAEAVALLSQ		RGPDALLTVA		LRKPPGQRTD		EELDLIFEEL		LHIKAVAHLS
NSVKRELAAV		LLFEPHSKAG		TVLFSQGDKG		TSWYIIWKGS		VNVVTHGKGL
VTTLHEGDDF		GQLALVNDAP		RAATIILRED		NCHFLRVDKQ		DFNRIIKDVE
AKTMRLEEHG		KVVLVLERAS		QGAGPSRPPT		PGRNRYTVMS		GTPEKILELL
LEAMGPDSSA		HDPTETFLSD		FLLTHRVFMP		SAQLCAALLH		HFHVEPAGGS
EQERSTYVCN		KRQQILRLVS		QWVALYGSML		HTDPVATSFL		QKLSDLVGRD
TRLSNLLREQ		WPERRRCHRL		ENGCGNASPQ		MKARNLPVWL		PNQDEPLPGS
SCAIQVGDKV		PYDICRPDHS		VLTLQLPVTA		SVREVMAALA		QEDGWTKGQV
LVKVNSAGDA		IGLQPDARGV		ATSLGLNERL		FVVNPQEVHE		LIPHPDQLGP
TVGSAEGLDL		VSAKDLAGQL		TDHDWSLFNS		IHQVELIHYV		LGPQHLRDVT
TANLERFMRR		FNELQYWVAT		ELCLCPVPGP		RAQLLRKFIK		LAAHLKEQKN
LNSFFAVMFG		LSNSAISRLA		HTWERLPHKV		RKLYSALERL		LDPSWNHRVY
RLALAKLSPP		VIPFMPLLLK		DMTFIHEGNH		TLVENLINFE		KMRMMARAAR
MLHHCRSHNP		VPLSPLRSRV		SHLHEDSQVA		RISTCSEQSL		STRSPASTWA
YVQQLKVIDN		QRELSRLSRE		LEP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12