RAPGEF5

RAPGEF5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WGY
Ідентифікатори
Символи	RAPGEF5, GFR, MR-GEF, REPAC, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, MRGEF
Зовнішні ІД	OMIM: 609527 MGI: 2444365 HomoloGene: 56563 GeneCards: RAPGEF5
Онтологія гена Молекулярна функція • GTP-dependent protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • small GTPase mediated signal transduction • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9771	217944
Ensembl	ENSG00000136237	ENSMUSG00000041992
UniProt	Q92565	Q8C0Q9
RefSeq (мРНК)	NM_012294 NM_001367600 NM_001367601 NM_001367602 NM_001367603	NM_175930 NM_001373989
RefSeq (білок)	NP_036426 NP_001354529 NP_001354530 NP_001354531 NP_001354532	NP_787126 NP_001360918
Локус (UCSC)	Хр. 7: 22.12 – 22.36 Mb	Хр. 12: 117.48 – 117.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAPGEF5 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 67 733.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSSRLRVFD		PHLERKDSAA		ALSDRELPLP		TFDVPYFKYI		DEEDEDDEWS
SRSQSSTEDD		SVDSLLSDRY		VVVSGTPEKI		LEHLLNDLHL		EEVQDKETET
LLDDFLLTYT		VFMTTDDLCQ		ALLRHYSAKK		YQGKEENSDV		PRRKRKVLHL
VSQWIALYKD		WLPEDEHSKM		FLKTIYRNVL		DDVYEYPILE		KELKEFQKIL
GMHRRHTVDE		YSPQKKNKAL		FHQFSLKENW		LQHRGTVTET		EEIFCHVYIT
EHSYVSVKAK		VSSIAQEILK		VVAEKIQYAE		EDLALVAITF		SGEKHELQPN
DLVISKSLEA		SGRIYVYRKD		LADTLNPFAE		NEESQQRSMR		ILGMNTWDLA
LELMNFDWSL		FNSIHEQELI		YFTFSRQGSG		EHTANLSLLL		QRCNEVQLWV
ATEILLCSQL		GKRVQLVKKF		IKIAAHCKAQ		RNLNSFFAIV		MGLNTASVSR
LSQTWEKIPG		KFKKLFSELE		SLTDPSLNHK		AYRDAFKKMK		PPKIPFMPLL
LKDVTFIHEG		NKTFLDNLVN		FEKLHMIADT		VRTLRHCRTN		QFGDLSPKEH
QELKSYVNHL		YVIDSQQALF		ELSHRIEPRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ichiba T., Hoshi Y., Eto Y., Tajima N., Kuraishi Y. (1999). Characterization of GFR, a novel guanine nucleotide exchange factor for Rap1. FEBS Lett. 457: 85—89. PMID 10486569 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01012-1
• Rebhun J.F., Castro A.F., Quilliam L.A. (2000). Identification of guanine nucleotide exchange factors (GEFs) for the Rap1 GTPase. Regulation of MR-GEF by M-Ras-GTP interaction. J. Biol. Chem. 275: 34901—34908. PMID 10934204 DOI:10.1074/jbc.M005327200

Див. також

• Хромосома 7