RAPGEF5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
RAPGEF5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи RAPGEF5, GFR, MR-GEF, REPAC, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, MRGEF
Зовнішні ІД OMIM: 609527 MGI: 2444365 HomoloGene: 56563 GeneCards: RAPGEF5
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_012294
NM_001367600
NM_001367601
NM_001367602
NM_001367603
NM_175930
NM_001373989
RefSeq (білок)
NP_036426
NP_001354529
NP_001354530
NP_001354531
NP_001354532
NP_787126
NP_001360918
Локус (UCSC) Хр. 7: 22.12 – 22.36 Mb Хр. 12: 117.48 – 117.72 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RAPGEF5 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 67 733[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGSSRLRVFDPHLERKDSAAALSDRELPLPTFDVPYFKYIDEEDEDDEWS
SRSQSSTEDDSVDSLLSDRYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLEEVQDKETET
LLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSAKKYQGKEENSDVPRRKRKVLHL
VSQWIALYKDWLPEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPILEKELKEFQKIL
GMHRRHTVDEYSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVTETEEIFCHVYIT
EHSYVSVKAKVSSIAQEILKVVAEKIQYAEEDLALVAITFSGEKHELQPN
DLVISKSLEASGRIYVYRKDLADTLNPFAENEESQQRSMRILGMNTWDLA
LELMNFDWSLFNSIHEQELIYFTFSRQGSGEHTANLSLLLQRCNEVQLWV
ATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCKAQRNLNSFFAIVMGLNTASVSR
LSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKKMKPPKIPFMPLL
LKDVTFIHEGNKTFLDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQFGDLSPKEH
QELKSYVNHLYVIDSQQALFELSHRIEPRV

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ichiba T., Hoshi Y., Eto Y., Tajima N., Kuraishi Y. (1999). Characterization of GFR, a novel guanine nucleotide exchange factor for Rap1. FEBS Lett. 457: 85—89. PMID 10486569 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01012-1
  • Rebhun J.F., Castro A.F., Quilliam L.A. (2000). Identification of guanine nucleotide exchange factors (GEFs) for the Rap1 GTPase. Regulation of MR-GEF by M-Ras-GTP interaction. J. Biol. Chem. 275: 34901—34908. PMID 10934204 DOI:10.1074/jbc.M005327200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16862 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, Q92565 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]