RBFOX3

RBFOX3
Ідентифікатори
Символи	RBFOX3, FOX-3, FOX3, HRNBP3, NEUN, RNA binding protein, fox-1 homolog 3, uncharacterized LOC644767
Зовнішні ІД	OMIM: 616999 MGI: 106368 HomoloGene: 140607 GeneCards: RBFOX3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • mRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • перикаріон • neuronal cell body • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of RNA splicing • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	146713	52897
Ensembl	ENSG00000167281	ENSMUSG00000025576
UniProt	A6NFN3 K7EJX6	Q8BIF2
RefSeq (мРНК)	NM_001039904	NM_001024931 NM_001039167 NM_001039168 NM_001285436 NM_001285437 NM_001285438
RefSeq (білок)	NP_001076044 NP_001337380 NP_001337382	NP_001020102 NP_001034256 NP_001034257 NP_001272365 NP_001272366 NP_001272367
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 11: 118.49 – 118.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBFOX3 (англ. RNA binding protein, fox-1 homolog 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 312 амінокислот, а молекулярна маса — 33 873.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQPYPPAQY		PPPPQNGIPA		EYAPPPPHPT		QDYSGQTPVP		TEHGMTLYTP
AQTHPEQPGS		EASTQPIAGT		QTVPQTDEAA		QTDSQPLHPS		DPTEKQQPKR
LHVSNIPFRF		RDPDLRQMFG		QFGKILDVEI		IFNERGSKGF		GFVTFETSSD
ADRAREKLNG		TIVEGRKIEV		NNATARVMTN		KKTGNPYTNG		WKLNPVVGAV
YGPEFYAVTG		FPYPTTGTAV		AYRGAHLRGR		GRAVYNTFRA		APPPPPIPTY
GAVVYQDGFY		GAEIYGGYAA		YRYAQPAAAA		AAYSDSYGRV		YAAADPYHHT
IGPAATYSIG		TM

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lucas C.H., Calvez M., Babu R., Brown A. (2014). Altered subcellular localization of the NeuN/Rbfox3 RNA splicing factor in HIV-associated neurocognitive disorders (HAND). Neurosci. Lett. 558: 97—102. PMID 24215932 DOI:10.1016/j.neulet.2013.10.037

Див. також

• Хромосома 17