RBM4B

RBM4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DGT
Ідентифікатори
Символи	RBM4B, RBM30, RBM4L, ZCCHC15, ZCCHC21B, ZCRB3B, RNA binding motif protein 4B
Зовнішні ІД	MGI: 1913954 HomoloGene: 57033 GeneCards: RBM4B
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • mRNA processing • GO:1901313 positive regulation of gene expression • entrainment of circadian clock by photoperiod • regulation of translation • циркадний ритм • circadian regulation of gene expression • Сплайсинг РНК • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83759	66704
Ensembl	ENSG00000173914	ENSMUSG00000033760
UniProt	Q9BQ04	Q8VE92
RefSeq (мРНК)	NM_001286135 NM_031492	NM_025717
RefSeq (білок)	NP_001273064 NP_113680	NP_079993
Локус (UCSC)	Хр. 11: 66.66 – 66.68 Mb	Хр. 19: 4.76 – 4.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM4B (англ. RNA binding motif protein 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 150.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVKLFIGNLP		REATEQEIRS		LFEQYGKVLE		CDIIKNYGFV		HIEDKTAAED
AIRNLHHYKL		HGVNINVEAS		KNKSKASTKL		HVGNISPTCT		NQELRAKFEE
YGPVIECDIV		KDYAFVHMER		AEDAVEAIRG		LDNTEFQGKR		MHVQLSTSRL
RTAPGMGDQS		GCYRCGKEGH		WSKECPVDRT		GRVADFTEQY		NEQYGAVRTP
YTMGYGESMY		YNDAYGALDY		YKRYRVRSYE		AVAAAAAASA		YNYAEQTMSH
LPQVQSTTVT		SHLNSTSVDP		YDRHLLPNSG		AAATSAAMAA		AAATTSSYYG
RDRSPLRRAA		AMLPTVGEGY		GYGPESELSQ		ASAATRNSLY		DMARYEREQY
VDRARYSAF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lai M.-C., Kuo H.-W., Chang W.-C., Tarn W.-Y. (2003). A novel splicing regulator shares a nuclear import pathway with SR proteins. EMBO J. 22: 1359—1369. PMID 12628928 DOI:10.1093/emboj/cdg126

Див. також

• Хромосома 11