RBM6

RBM6
Ідентифікатори
Символи	RBM6, 3G2, DEF-3, DEF3, HLC-11, NY-LU-12, g16, RNA binding motif protein 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606886 MGI: 1338037 HomoloGene: 31336 GeneCards: RBM6
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10180	19654
Ensembl	ENSG00000004534	ENSMUSG00000032582
UniProt	P78332	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001167582 NM_005777 NM_001349190 NM_001349191 NM_001349192 NM_001349193 NM_001349194	NM_011251 NM_029169
RefSeq (білок)	NP_001161054 NP_005768 NP_001336119 NP_001336120 NP_001336121 NP_001336122 NP_001336123	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 49.94 – 50.1 Mb	Хр. 9: 107.65 – 107.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM6 (англ. RNA binding motif protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 123 амінокислот, а молекулярна маса — 128 644.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWGDSRPANR		TGPFRGSQEE		RFAPGWNRDY		PPPPLKSHAQ		ERHSGNFPGR
DSLPFDFQGH		SGPPFANVEE		HSFSYGARDG		PHGDYRGGEG		PGHDFRGGDF
SSSDFQSRDS		SQLDFRGRDI		HSGDFRDREG		PPMDYRGGDG		TSMDYRGREA
PHMNYRDRDA		HAVDFRGRDA		PPSDFRGRGT		YDLDFRGRDG		SHADFRGRDL
SDLDFRAREQ		SRSDFRNRDV		SDLDFRDKDG		TQVDFRGRGS		GTTDLDFRDR
DTPHSDFRGR		HRSRTDQDFR		GREMGSCMEF		KDREMPPVDP		NILDYIQPST
QDREHSGMNV		NRREESTHDH		TIERPAFGIQ		KGEFEHSETR		EGETQGVAFE
HESPADFQNS		QSPVQDQDKS		QLSGREEQSS		DAGLFKEEGG		LDFLGRQDTD
YRSMEYRDVD		HRLPGSQMFG		YGQSKSFPEG		KTARDAQRDL		QDQDYRTGPS
EEKPSRLIRL		SGVPEDATKE		EILNAFRTPD		GMPVKNLQLK		EYNTGYDYGY
VCVEFSLLED		AIGCMEANQG		TLMIQDKEVT		LEYVSSLDFW		YCKRCKANIG
GHRSSCSFCK		NPREVTEAKQ		ELITYPQPQK		TSIPAPLEKQ		PNQPLRPADK
EPEPRKREEG		QESRLGHQKR		EAERYLPPSR		REGPTFRRDR		ERESWSGETR
QDGESKTIML		KRIYRSTPPE		VIVEVLEPYV		RLTTANVRII		KNRTGPMGHT
YGFIDLDSHA		EALRVVKILQ		NLDPPFSIDG		KMVAVNLATG		KRRNDSGDHS
DHMHYYQGKK		YFRDRRGGGR		NSDWSSDTNR		QGQQSSSDCY		IYDSATGYYY
DPLAGTYYDP		NTQQEVYVPQ		DPGLPEEEEI		KEKKPTSQGK		SSSKKEMSKR
DGKEKKDRGV		TRFQENASEG		KAPAEDVFKK		PLPPTVKKEE		SPPPPKVVNP
LIGLLGEYGG		DSDYEEEEEE		EQTPPPQPRT		AQPQKREEQT		KKENEEDKLT
DWNKLACLLC		RRQFPNKEVL		IKHQQLSDLH		KQNLEIHRKI		KQSEQELAYL
ERREREGKFK		GRGNDRREKL		QSFDSPERKR		IKYSRETDSD		RKLVDKEDID
TSSKGGCVQQ		ATGWRKGTGL		GYGHPGLASS		EEAEGRMRGP		SVGASGRTSK
RQSNETYRDA		VRRVMFARYK		ELD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mishra M., Akatsu H., Heese K. (2011). The novel protein MANI modulates neurogenesis and neurite-cone growth. J. Cell. Mol. Med. 15: 1713—1725. PMID 20716133 DOI:10.1111/j.1582-4934.2010.01134.x
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Lerman M.I., Minna J.D. (2000). The 630-kb lung cancer homozygous deletion region on human chromosome 3p21.3: identification and evaluation of the resident candidate tumor suppressor genes. Cancer Res. 60: 6116—6133. PMID 11085536

Див. також

• Хромосома 3