RBM8A

RBM8A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P27, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2XB2, 3EX7
Ідентифікатори
Символи	RBM8A, BOV-1A, BOV-1B, BOV-1C, C1DELq21.1, DEL1q21.1, MDS014, RBM8, RBM8B, TAR, Y14, ZNRP, ZRNP1, RNA binding motif protein 8A
Зовнішні ІД	OMIM: 605313 MGI: 1913129 HomoloGene: 3744 GeneCards: RBM8A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • catalytic step 2 spliceosome • exon-exon junction complex • soma • дендрит (нейробіологія) • spliceosomal complex • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • nuclear speck • U2-type catalytic step 1 spliceosome Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA transport • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • regulation of translation • RNA export from nucleus • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • Сплайсинг РНК • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9939	60365
Ensembl	ENSG00000265241	ENSMUSG00000038374
UniProt	Q9Y5S9	Q9CWZ3
RefSeq (мРНК)	NM_005105	NM_001102407 NM_025875
RefSeq (білок)	NP_005096	NP_001095877 NP_080151
Локус (UCSC)	Хр. 1: 145.92 – 145.93 Mb	Хр. 3: 96.54 – 96.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM8A (англ. RNA binding motif protein 8A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 174 амінокислот, а молекулярна маса — 19 889.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADVLDLHEA		GGEDFAMDED		GDESIHKLKE		KAKKRKGRGF		GSEEGSRARM
REDYDSVEQD		GDEPGPQRSV		EGWILFVTGV		HEEATEEDIH		DKFAEYGEIK
NIHLNLDRRT		GYLKGYTLVE		YETYKEAQAA		MEGLNGQDLM		GQPISVDWCF
VRGPPKGKRR		GGRRRSRSPD		RRRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Zhao X.F., Nowak N.J., Shows T.B., Aplan P.D. (2000). MAGOH interacts with a novel RNA-binding protein. Genomics. 63: 145—148. PMID 10662555 DOI:10.1006/geno.1999.6064
• Faurholm B., Millar R.P., Katz A.A. (2001). The genes encoding the type II gonadotropin-releasing hormone receptor and the ribonucleoprotein RBM8A in humans overlap in two genomic loci. Genomics. 78: 15—18. PMID 11707068 DOI:10.1006/geno.2001.6650
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Le Hir H., Izaurralde E., Maquat L.E., Moore M.J. (2000). The spliceosome deposits multiple proteins 20-24 nucleotides upstream of mRNA exon-exon junctions. EMBO J. 19: 6860—6869. PMID 11118221 DOI:10.1093/emboj/19.24.6860
• Mingot J.-M., Kostka S., Kraft R., Hartmann E., Goerlich D. (2001). Importin 13: a novel mediator of nuclear import and export. EMBO J. 20: 3685—3694. PMID 11447110 DOI:10.1093/emboj/20.14.3685
• Kataoka N., Diem M.D., Kim V.N., Yong J., Dreyfuss G. (2001). Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex. EMBO J. 20: 6424—6433. PMID 11707413 DOI:10.1093/emboj/20.22.6424

Див. також

• Хромосома 1