RBMS1

RBMS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X5O
Ідентифікатори
Символи	RBMS1, C2orf12, HCC-4, MSSP, MSSP-1, MSSP-2, MSSP-3, SCR2, YC1, RNA binding motif single stranded interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602310 MGI: 1861774 HomoloGene: 9640 GeneCards: RBMS1
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • poly(A) binding • poly(U) RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • Реплікація ДНК • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5937	56878
Ensembl	ENSG00000153250	ENSMUSG00000026970
UniProt	P29558	Q91W59
RefSeq (мРНК)	NM_002897 NM_016836 NM_016839	NM_001141931 NM_001141932 NM_020296
RefSeq (білок)	NP_002888 NP_058520	NP_001135403 NP_001135404 NP_064692
Локус (UCSC)	Хр. 2: 160.27 – 160.49 Mb	Хр. 2: 60.58 – 60.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBMS1 (англ. RNA binding motif single stranded interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 44 505.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKVWKQQMY		PQYATYYYPQ		YLQAKQSLVP		AHPMAPPSPS		TTSSNNNSSS
SSNSGWDQLS		KTNLYIRGLP		PHTTDQDLVK		LCQPYGKIVS		TKAILDKTTN
KCKGYGFVDF		DSPAAAQKAV		SALKASGVQA		QMAKQQEQDP		TNLYISNLPL
SMDEQELENM		LKPFGQVIST		RILRDSSGTS		RGVGFARMES		TEKCEAVIGH
FNGKFIKTPP		GVSAPTEPLL		CKFADGGQKK		RQNPNKYIPN		GRPWHREGEV
RLAGMTLTYD		PTTAAIQNGF		YPSPYSIATN		RMITQTSITP		YIASPVSAYQ
VQSPSWMQPQ		PYILQHPGAV		LTPSMEHTMS		LQPASMISPL		AQQMSHLSLG
STGTYMPATS		AMQGAYLPQY		AHMQTTAVPV		EEASGQQQVA		VETSNDHSPY
TFQPNK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kanaoka Y., Nojima H. (1994). SCR: novel human suppressors of cdc2/cdc13 mutants of Schizosaccharomyces pombe harbour motifs for RNA binding proteins. Nucleic Acids Res. 22: 2687—2693. PMID 8041632 DOI:10.1093/nar/22.13.2687
• Takai T., Nishita Y., Iguchi-Ariga S.M.M., Ariga H. (1994). Molecular cloning of MSSP-2, a c-myc gene single-strand binding protein: characterization of binding specificity and DNA replication activity. Nucleic Acids Res. 22: 5576—5581. PMID 7838710 DOI:10.1093/nar/22.25.5576
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2