RCL1

RCL1
Ідентифікатори
Символи	RCL1, RNAC, RPCL1, RNA terminal phosphate cyclase like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611405 MGI: 1913275 HomoloGene: 4217 GeneCards: RCL1
Онтологія гена Молекулярна функція • каталітична активність • RNA-3'-phosphate cyclase activity • endoribonuclease activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • ribosome biogenesis • endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • rRNA processing • endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10171	59028
Ensembl	ENSG00000120158	ENSMUSG00000024785
UniProt	Q9Y2P8	Q9JJT0
RefSeq (мРНК)	NM_001286699 NM_001286700 NM_001286701 NM_005772	NM_021525
RefSeq (білок)	NP_001273628 NP_001273629 NP_001273630 NP_005763	NP_067500
Локус (UCSC)	Хр. 9: 4.79 – 4.89 Mb	Хр. 19: 29.08 – 29.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RCL1 (англ. RNA terminal phosphate cyclase like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 40 843.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATQAHSLSY		AGCNFLRQRL		VLSTLSGRPV		KIRKIRARDD		NPGLRDFEAS
FIRLLDKITN		GSRIEINQTG		TTLYYQPGLL		YGGSVEHDCS		VLRGIGYYLE
SLLCLAPFMK		HPLKIVLRGV		TNDQVDPSVD		VLKATALPLL		KQFGIDGESF
ELKIVRRGMP		PGGGGEVVFS		CPVRKVLKPI		QLTDPGKIKR		IRGMAYSVRV
SPQMANRIVD		SARSILNKFI		PDIYIYTDHM		KGVNSGKSPG		FGLSLVAETT
SGTFLSAELA		SNPQGQGAAV		LPEDLGRNCA		RLLLEEIYRG		GCVDSTNQSL
ALLLMTLGQQ		DVSKVLLGPL		SPYTIEFLRH		LKSFFQIMFK		IETKPCGEEL
KGGDKVLMTC		VGIGFSNLSK		TLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Billy E., Wegierski T., Nasr F., Filipowicz W. (2000). Rcl1p, the yeast protein similar to the RNA 3'-phosphate cyclase, associates with U3 snoRNP and is required for 18S rRNA biogenesis. EMBO J. 19: 2115—2126. PMID 10790377 DOI:10.1093/emboj/19.9.2115
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9