RFX7

RFX7
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 4QQI, 4QQM
Ідентифікатори
Символи	RFX7, RFXDC2, regulatory factor X7
Зовнішні ІД	OMIM: 612660 MGI: 2442675 HomoloGene: 11275 GeneCards: RFX7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64864	319758
Ensembl	ENSG00000181827	ENSMUSG00000037674
UniProt	Q2KHR2	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_022841 NM_001368073 NM_001368074 NM_001370554 NM_001370561	NM_001033536
RefSeq (білок)	NP_073752 NP_001355002 NP_001355003 NP_001357483 NP_001357490	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 15: 56.09 – 56.25 Mb	Хр. 9: 72.44 – 72.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFX7 (англ. Regulatory factor X7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 363 амінокислот, а молекулярна маса — 146 896.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSSRAQQMH		AFSWIRNTLE		EHPETSLPKQ		EVYDEYKSYC		DNLGYHPLSA
ADFGKIMKNV		FPNMKARRLG		TRGKSKYCYS		GLRKKAFVHM		PTLPNLDFHK
TGDGLEGAEP		SGQLQNIDEE		VISSACRLVC		EWAQKVLSQP		FDTVLELARF
LVKSHYIGTK		SMAALTVMAA		APAGMKGITQ		PSAFIPTAES		NSFQPQVKTL
PSPIDAKQQL		QRKIQKKQQE		QKLQSPLPGE		SAAKKSESAT		SNGVTNLPNG
NPSILSPQPI		GIVVAAVPSP		IPVQRTRQLV		TSPSPMSSSD		GKVLPLNVQV
VTQHMQSVKQ		APKTPQNVPA		SPGGDRSARH		RYPQILPKPA		NTSALTIRSP
TTVLFTSSPI		KTAVVPASHM		SSLNVVKMTT		ISLTPSNSNT		PLKHSASVSS
ATGTTEESRS		VPQIKNGSVV		SLQSPGSRSS		SAGGTSAVEV		KVEPETSSDE
HPVQCQENSD		EAKAPQTPSA		LLGQKSNTDG		ALQKPSNEGV		IEIKATKVCD
QRTKCKSRCN		EMLPGTSTGN		NQSTITLSVA		SQNLTFTSSS		SPPNGDSINK
DPKLCTKSPR		KRLSSTLQET		QVPPVKKPIV		EQLSAATIEG		QKQGSVKKDQ
KVPHSGKTEG		STAGAQIPSK		VSVNVSSHIG		ANQPLNSSAL		VISDSALEQQ
TTPSSSPDIK		VKLEGSVFLL		DSDSKSVGSF		NPNGWQQITK		DSEFISASCE
QQQDISVMTI		PEHSDINDLE		KSVWELEGMP		QDTYSQQLHS		QIQESSLNQI
QAHSSDQLPL		QSELKEFEPS		VSQTNESYFP		FDDELTQDSI		VEELVLMEQQ
MSMNNSHSYG		NCLGMTLQSQ		SVTPGAPMSS		HTSSTHFYHP		IHSNGTPIHT
PTPTPTPTPT		PTPTPTPTSE		MIAGSQSLSR		ESPCSRLAQT		TPVDSALGSS
RHTPIGTPHS		NCSSSVPPSP		VECRNPFAFT		PISSSMAYHD		ASIVSSSPVK
PMQRPMATHP		DKTKLEWMNN		GYSGVGNSSV		SGHGILPSYQ		ELVEDRFRKP
HAFAVPGQSY		QSQSRHHDTH		FGRLTPVSPV		QHQGATVNNT		NKQEGFAVPA
PLDNKGTNSS		ASSNFRCRSV		SPAVHRQRNL		SGSTLYPVSN		IPRSNVTPFG
SPVTPEVHVF		TNVHTDACAN		NIAQRSQSVP		LTVMMQTAFP		NALQKQANSK
KITNVLLSKL		DSDNDDAVRG		LGMNNLPSNY		TARMNLTQIL		EPSTVFPSAN
PQNMIDSSTS		VYEFQTPSYL		TKSNSTGQIN		FSPGDNQAQS		EIGEQQLDFN
STVKDLLSGD		SLQTNQQLVG		QGASDLTNTA		SDFSSDIRLS		SELSGSINDL
NTLDPNLLFD		PGRQQGQDDE		ATLEELKNDP		LFQQICSESM		NSMTSSGFEW
IESKDHPTVE		MLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aftab S., Semenec L., Chu J.S.-C., Chen N. (2008). Identification and characterization of novel human tissue-specific RFX transcription factors. BMC Evol. Biol. 8: 226—226. PMID 18673564 DOI:10.1186/1471-2148-8-226

Див. також

• Хромосома 15