RFXAP

RFXAP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KW3
Ідентифікатори
Символи	RFXAP, regulatory factor X associated protein
Зовнішні ІД	OMIM: 601861 MGI: 2180854 HomoloGene: 452 GeneCards: RFXAP
Пов'язані генетичні захворювання
bare lymphocyte syndrome 2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • nuclear speck Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5994	170767
Ensembl	ENSG00000133111	ENSMUSG00000036615
UniProt	O00287	Q8VCG9
RefSeq (мРНК)	NM_000538	NM_133231
RefSeq (білок)	NP_000529	NP_573494
Локус (UCSC)	Хр. 13: 36.82 – 36.83 Mb	Хр. 3: 54.71 – 54.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFXAP (англ. Regulatory factor X associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 28 232.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAQGVAEGA		GPGAASGVPH		PAALAPAAAP		TLAPASVAAA		ASQFTLLVMQ
PCAGQDEAAA		PGGSVGAGKP		VRYLCEGAGD		GEEEAGEDEA		DLLDTSDPPG
GGESAASLED		LEDEETHSGG		EGSSGGARRR		GSGGGSMSKT		CTYEGCSETT
SQVAKQRKPW		MCKKHRNKMY		KDKYKKKKSD		QALNCGGTAS		TGSAGNVKLE
ESADNILSIV		KQRTGSFGDR		PARPTLLEQV		LNQKRLSLLR		SPEVVQFLQK
QQQLLNQQVL		EQRQQQFPGT		SM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Laird K.M., Briggs L.L., Boss J.M., Summers M.F., Garvie C.W. (2010). Solution structure of the heterotrimeric complex between the interaction domains of RFX5 and RFXAP from the RFX gene regulatory complex. J. Mol. Biol. 403: 40—51. PMID 20732328 DOI:10.1016/j.jmb.2010.08.025

Див. також

• Хромосома 13