RHOT1

RHOT1
Ідентифікатори
Символи	RHOT1, ARHT1, MIRO-1, MIRO1, ras homolog family member T1
Зовнішні ІД	OMIM: 613888 MGI: 1926078 HomoloGene: 56803 GeneCards: RHOT1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0006184 GTPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • GTP binding • молекулярна функція Клітинна компонента • integral component of membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • мітохондрія • integral component of mitochondrial outer membrane • мітохондріальна зовнішня мембрана Біологічний процес • cellular homeostasis • regulation of small GTPase mediated signal transduction • mitochondrial outer membrane permeabilization • mitochondrion organization • protein deubiquitination • establishment of mitochondrion localization by microtubule attachment • regulation of neurotransmitter secretion • regulation of organelle transport along microtubule • mitochondrion transport along microtubule • Rho protein signal transduction • regulation of mitochondrion organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55288	59040
Ensembl	ENSG00000126858	ENSMUSG00000017686
UniProt	Q8IXI2	Q8BG51
RefSeq (мРНК)	NM_001033566 NM_001033567 NM_001033568 NM_001288754 NM_001288755 NM_001288758 NM_018307	NM_001163354 NM_001163355 NM_021536 NM_001362868 NM_001362869 NM_001362870
RefSeq (білок)	NP_001028738 NP_001028739 NP_001028740 NP_001275683 NP_001275684 NP_001275687 NP_060777	NP_001156826 NP_001156827 NP_067511 NP_001349797 NP_001349798 NP_001349799 NP_001391057 NP_001391058
Локус (UCSC)	Хр. 17: 32.14 – 32.25 Mb	Хр. 11: 80.1 – 80.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RHOT1 (англ. Ras homolog family member T1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 618 амінокислот, а молекулярна маса — 70 784.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKKDVRILLV		GEPRVGKTSL		IMSLVSEEFP		EEVPPRAEEI		TIPADVTPER
VPTHIVDYSE		AEQSDEQLHQ		EISQANVICI		VYAVNNKHSI		DKVTSRWIPL
INERTDKDSR		LPLILVGNKS		DLVEYSSMET		ILPIMNQYTE		IETCVECSAK
NLKNISELFY		YAQKAVLHPT		GPLYCPEEKE		MKPACIKALT		RIFKISDQDN
DGTLNDAELN		FFQRICFNTP		LAPQALEDVK		NVVRKHISDG		VADSGLTLKG
FLFLHTLFIQ		RGRHETTWTV		LRRFGYDDDL		DLTPEYLFPL		LKIPPDCTTE
LNHHAYLFLQ		STFDKHDLDR		DCALSPDELK		DLFKVFPYIP		WGPDVNNTVC
TNERGWITYQ		GFLSQWTLTT		YLDVQRCLEY		LGYLGYSILT		EQESQASAVT
VTRDKKIDLQ		KKQTQRNVFR		CNVIGVKNCG		KSGVLQALLG		RNLMRQKKIR
EDHKSYYAIN		TVYVYGQEKY		LLLHDISESE		FLTEAEIICD		VVCLVYDVSN
PKSFEYCARI		FKQHFMDSRI		PCLIVAAKSD		LHEVKQEYSI		SPTDFCRKHK
MPPPQAFTCN		TADAPSKDIF		VKLTTMAMYP		HVTQADLKSS		TFWLRASFGA
TVFAVLGFAM		YKALLKQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію, ГТФ. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

• Fransson A., Ruusala A., Aspenstroem P. (2003). Atypical Rho GTPases have roles in mitochondrial homeostasis and apoptosis. J. Biol. Chem. 278: 6495—6502. PMID 12482879 DOI:10.1074/jbc.M208609200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aspenstroem P., Fransson A., Saras J. (2004). Rho GTPases have diverse effects on the organization of the actin filament system. Biochem. J. 377: 327—337. PMID 14521508 DOI:10.1042/BJ20031041
• Fransson S., Ruusala A., Aspenstroem P. (2006). The atypical Rho GTPases Miro-1 and Miro-2 have essential roles in mitochondrial trafficking. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 500—510. PMID 16630562 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.03.163

Див. також

• Хромосома 17