RIF1

RIF1
Ідентифікатори
Символи	RIF1, replication timing regulatory factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608952 MGI: 1098622 HomoloGene: 41231 GeneCards: RIF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • теломера • клітинна мембрана • веретено поділу • male pronucleus • female pronucleus • клітинне ядро • цитоскелет • нуклеоплазма • хромосома • condensed chromosome • ядерні тільця • ядерна мембрана • spindle midzone • site of double-strand break Біологічний процес • stem cell population maintenance • клітинний цикл • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • telomere maintenance • telomere maintenance in response to DNA damage • positive regulation of histone H3-K9 methylation • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of isotype switching • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination • positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to leukemia inhibitory factor Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55183	51869
Ensembl	ENSG00000080345	ENSMUSG00000036202
UniProt	Q5UIP0	Q6PR54
RefSeq (мРНК)	NM_001177663 NM_001177664 NM_001177665 NM_018151	NM_175238 NM_001355414 NM_001355415
RefSeq (білок)	NP_001171134 NP_001171135 NP_001171136 NP_060621	NP_780447 NP_001342343 NP_001342344
Локус (UCSC)	Хр. 2: 151.41 – 151.51 Mb	Хр. 2: 51.96 – 52.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIF1 (англ. Replication timing regulatory factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 472 амінокислот, а молекулярна маса — 274 466.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTARGQSPLA		PLLETLEDPS		ASHGGQTDAY		LTLTSRMTGE		EGKEVITEIE
KKLPRLYKVL		KTHISSQNSE		LSSAALQALG		FCLYNPKITS		ELSEANALEL
LSKLNDTIKN		SDKNVRTRAL		WVISKQTFPS		EVVGKMVSSI		IDSLEILFNK
GETHSAVVDF		EALNVIVRLI		EQAPIQMGEE		AVRWAKLVIP		LVVHSAQKVH
LRGATALEMG		MPLLLQKQQE		IASITEQLMT		TKLISELQKL		FMSKNETYVL
KLWPLFVKLL		GRTLHRSGSF		INSLLQLEEL		GFRSGAPMIK		KIAFIAWKSL
IDNFALNPDI		LCSAKRLKLL		MQPLSSIHVR		TETLALTKLE		VWWYLLMRLG
PHLPANFEQV		CVPLIQSTIS		IDSNASPQGN		SCHVATSPGL		NPMTPVHKGA
SSPYGAPGTP		RMNLSSNLGG		MATIPSIQLL		GLEMLLHFLL		GPEALSFAKQ
NKLVLSLEPL		EHPLISSPSF		FSKHANTLIT		AVHDSFVAVG		KDAPDVVVSA
IWKELISLVK		SVTESGNKKE		KPGSEVLTLL		LKSLESIVKS		EVFPVSKTLV
LMEITIKGLP		QKVLGSPAYQ		VANMDILNGT		PALFLIQLIF		NNFLECGVSD
ERFFLSLESL		VGCVLSGPTS		PLAFSDSVLN		VINQNAKQLE		NKEHLWKMWS
VIVTPLTELI		NQTNEVNQGD		ALEHNFSAIY		GALTLPVNHI		FSEQRFPVAT
MKTLLRTWSE		LYRAFARCAA		LVATAEENLC		CEELSSKIMS		SLEDEGFSNL
LFVDRIIYII		TVMVDCIDFS		PYNIKYQPKV		KSPQRPSDWS		KKKNEPLGKL
TSLFKLIVKV		IYSFHTLSFK		EAHSDTLFTI		GNSITGIISS		VLGHISLPSM
IRKIFATLTR		PLALFYENSK		LDEVPKVYSC		LNNKLEKLLG		EIIACLQFSY
TGTYDSELLE		QLSPLLCIIF		LHKNKQIRKQ		SAQFWNATFA		KVMMLVYPEE
LKPVLTQAKQ		KFLLLLPGLE		TVEMMEESSG		PYSDGTENSQ		LNVKISGMER
KSNGKRDSFL		AQTKNKKENM		KPAAKLKLES		SSLKVKGEIL		LEEEKSTDFV
FIPPEGKDAK		ERILTDHQKE		VLKTKRCDIP		AMYNNLDVSQ		DTLFTQYSQE
EPMEIPTLTR		KPKEDSKMMI		TEEQMDSDIV		IPQDVTEDCG		MAEHLEKSSL
SNNECGSLDK		TSPEMSNSNN		DERKKALISS		RKTSTECASS		TENSFVVSSS
SVSNTTVAGT		PPYPTSRRQT		FITLEKFDGS		ENRPFSPSPL		NNISSTVTVK
NNQETMIKTD		FLPKAKQREG		TFSKSDSEKI		VNGTKRSSRR		AGKAEQTGNK
RSKPLMRSEP		EKNTEESVEG		IVVLENNPPG		LLNQTECVSD		NQVHLSESTM
EHDNTKLKAA		TVENAVLLET		NTVEEKNVEI		NLESKENTPP		VVISADQMVN
EDSQVQITPN		QKTLRRSSRR		RSEVVESTTE		SQDKENSHQK		KERRKEEEKP
LQKSPLHIKD		DVLPKQKLIA		EQTLQENLIE		KGSNLHEKTL		GETSANAETE
QNKKKADPEN		IKSEGDGTQD		IVDKSSEKLV		RGRTRYQTRR		ASQGLLSSIE
NSESDSSEAK		EEGSRKKRSG		KWKNKSNESV		DIQDQEEKVV		KQECIKAENQ
SHDYKATSEE		DVSIKSPICE		KQDESNTVIC		QDSTVTSDLL		QVPDDLPNVC
EEKNETSKYA		EYSFTSLPVP		ESNLRTRNAI		KRLHKRDSFD		NCSLGESSKI
GISDISSLSE		KTFQTLECQH		KRSRRVRRSK		GCDCCGEKSQ		PQEKSLIGLK
NTENNDVEIS		ETKKADVQAP		VSPSETSQAN		PYSEGQFLDE		HHSVNFHLGL
KEDNDTINDS		LIVSETKSKE		NTMQESLPSG		IVNFREEICD		MDSSEAMSLE
SQESPNENFK		TVGPCLGDSK		NVSQESLETK		EEKPEETPKM		ELSLENVTVE
GNACKVTESN		LEKAKTMELN		VGNEASFHGQ		ERTKTGISEE		AAIEENKRND
DSEADTAKLN		AKEVATEEFN		SDISLSDNTT		PVKLNAQTEI		SEQTAAGELD
GGNDVSDLHS		SEETNTKMKN		NEEMMIGEAM		AETGHDGETE		NEGITTKTSK
PDEAETNMLT		AEMDNFVCDT		VEMSTEEGII		DANKTETNTE		YSKSEEKLDN
NQMVMESDIL		QEDHHTSQKV		EEPSQCLASG		TAISELIIED		NNASPQKLRE
LDPSLVSAND		SPSGMQTRCV		WSPLASPSTS		ILKRGLKRSQ		EDEISSPVNK
VRRVSFADPI		YQAGLADDID		RRCSIVRSHS		SNSSPIGKSV		KTSPTTQSKH
NTTSAKGFLS		PGSRSPKFKS		SKKCLISEMA		KESIPCPTES		VYPPLVNCVA
PVDIILPQIT		SNMWARGLGQ		LIRAKNIKTI		GDLSTLTASE		IKTLPIRSPK
VSNVKKALRI		YHEQQVKTRG		LEEIPVFDIS		EKTVNGIENK		SLSPDEERLV
SDIIDPVALE		IPLSKNLLAQ		ISALALQLDS		EDLHNYSGSQ		LFEMHEKLSC
MANSVIKNLQ		SRWRSPSHEN		SI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

• Silverman J., Takai H., Buonomo S.B.C., Eisenhaber F., De Lange T. (2004). Human Rif1, ortholog of a yeast telomeric protein, is regulated by ATM and 53BP1 and functions in the S-phase checkpoint. Genes Dev. 18: 2108—2119. PMID 15342490 DOI:10.1101/gad.1216004
• Xu L., Blackburn E.H. (2004). Human Rif1 protein binds aberrant telomeres and aligns along anaphase midzone microtubules. J. Cell Biol. 167: 819—830. PMID 15583028 DOI:10.1083/jcb.200408181
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 2