RILP

RILP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YHN
Ідентифікатори
Символи	RILP, PP10141, Rab interacting lysosomal protein
Зовнішні ІД	OMIM: 607848 MGI: 2144271 HomoloGene: 19596 GeneCards: RILP
Онтологія гена Молекулярна функція • dynein light intermediate chain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • small GTPase binding • protein dimerization activity Клітинна компонента • ендосома • late endosome • phagocytic vesicle membrane • мембрана • late endosome membrane • lysosomal membrane • лізосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • ciliary basal body • GO:0009327 protein-containing complex • цитоплазма Біологічний процес • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • endosome to lysosome transport • early endosome to late endosome transport • intralumenal vesicle formation • regulation of multivesicular body size • protein transport • cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83547	280408
Ensembl	ENSG00000274145 ENSG00000167705	ENSMUSG00000038195
UniProt	Q96NA2	Q5ND29
RefSeq (мРНК)	NM_031430	NM_001029938
RefSeq (білок)	NP_113618	NP_001025109
Локус (UCSC)	Хр. 17: 1.65 – 1.65 Mb	Хр. 11: 75.4 – 75.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RILP (англ. Rab interacting lysosomal protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 401 амінокислот, а молекулярна маса — 44 200.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPRRAAPGV		PGWGSREAAG		SASAAELVYH		LAGALGTELQ		DLARRFGPEA
AAGLVPLVVR		ALELLEQAAV		GPAPDSLQVS		AQPAEQELRR		LREENERLRR
ELRAGPQEER		ALLRQLKEVT		DRQRDELRAH		NRDLRQRGQE		TEALQEQLQR
LLLVNAELRH		KLAAMQTQLR		AAQDRERERQ		QPGEAATPQA		KERARGQAGR
PGHQHGQEPE		WATAGAGAPG		NPEDPAEAAQ		QLGRPSEAGQ		CRFSREEFEQ
ILQERNELKA		KVFLLKEELA		YFQRELLTDH		RVPGLLLEAM		KVAVRKQRKK
IKAKMLGTPE		EAESSEDEAG		PWILLSDDKG		DHPPPPESKI		QSFFGLWYRG
KAESSEDETS		SPAPSKLGGE		EEAQPQSPAP		DPPCSALHEH		LCLGASAAPE
A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

• Cantalupo G., Alifano P., Roberti V., Bruni C.B., Bucci C. (2001). Rab-interacting lysosomal protein (RILP): the Rab7 effector required for transport to lysosomes. EMBO J. 20: 683—693. PMID 11179213 DOI:10.1093/emboj/20.4.683
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bucci C., De Gregorio L., Bruni C.B. (2001). Expression analysis and chromosomal assignment of PRA1 and RILP genes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 286: 815—819. PMID 11520070 DOI:10.1006/bbrc.2001.5466
• Wang T., Hong W. (2002). Interorganellar regulation of lysosome positioning by the Golgi apparatus through Rab34 interaction with Rab-interacting lysosomal protein. Mol. Biol. Cell. 13: 4317—4332. PMID 12475955 DOI:10.1091/mbc.E02-05-0280
• Harrison R.E., Bucci C., Vieira O.V., Schroer T.A., Grinstein S. (2003). Phagosomes fuse with late endosomes and/or lysosomes by extension of membrane protrusions along microtubules: role of Rab7 and RILP. Mol. Cell. Biol. 23: 6494—6506. PMID 12944476 DOI:10.1128/MCB.23.18.6494-6506.2003
• Wang T., Wong K.K., Hong W. (2004). A unique region of RILP distinguishes it from its related proteins in its regulation of lysosomal morphology and interaction with Rab7 and Rab34. Mol. Biol. Cell. 15: 815—826. PMID 14668488 DOI:10.1091/mbc.E03-06-0413

Див. також

• Хромосома 17