RIMS1

RIMS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CSS
Ідентифікатори
Символи	RIMS1, CORD7, RAB3IP2, RIM, RIM1, regulating synaptic membrane exocytosis 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606629 MGI: 2152971 HomoloGene: 128399 GeneCards: RIMS1
Пов'язані генетичні захворювання
cone-rod dystrophy 7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005083 GTPase regulator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane transporter binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • синапс • presynaptic active zone • міжклітинні контакти • presynaptic membrane • cytoskeleton of presynaptic active zone • presynaptic active zone cytoplasmic component Біологічний процес • диференціація клітин • відповідь на стимул • synaptic vesicle exocytosis • positive regulation of inhibitory postsynaptic potential • membrane fusion • regulation of neurotransmitter secretion • секреція • glutamate secretion • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of excitatory postsynaptic potential • positive regulation of dendrite extension • regulated exocytosis • intracellular protein transport • neurotransmitter transport • GO:0010554 neurotransmitter secretion • зір • calcium-ion regulated exocytosis • екзоцитоз • GO:0048552 regulation of catalytic activity • regulation of membrane potential • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of synaptic vesicle exocytosis • GO:0015915 транспорт • regulation of synaptic plasticity • positive regulation of synaptic transmission • GO:0034622 protein-containing complex assembly • acrosomal vesicle exocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22999	116837
Ensembl	ENSG00000079841	ENSMUSG00000041670
UniProt	Q86UR5	Q99NE5
RefSeq (мРНК)	NM_001168407 NM_001168408 NM_001168409 NM_001168410 NM_001168411 NM_014989	NM_001012623 NM_001012624 NM_001012625 NM_053270 NM_183018
RefSeq (білок)	NP_001161879 NP_001161880 NP_001161881 NP_001161882 NP_001161883 NP_055804 NP_001337340 NP_001337341 NP_001337342 NP_001337343 NP_001337344 NP_001337345 NP_001337346 NP_001337347 NP_001337348 NP_001337349 NP_001337350 NP_001337351 NP_001337352 NP_001337353 NP_001337354 NP_001337355 NP_001337356 NP_001337357 NP_001337358 NP_001337359 NP_001337360 NP_001337361 NP_001337362 NP_001337363 NP_001337364 NP_001337365 NP_001337366 NP_001337367 NP_001337368 NP_001337369 NP_001337370 NP_001337371 NP_001337372 NP_001337373 NP_001337374 NP_001337375 NP_001337376 NP_001337377 NP_001337378 NP_001337379 NP_001337381 NP_001337383 NP_001337384 NP_001337385 NP_001337386 NP_001337387 NP_001337388 NP_001337389 NP_001337390 NP_001337391 NP_001337392 NP_001337393 NP_001337394 NP_001337395 NP_001337396 NP_001337397 NP_001337398 NP_001337399 NP_001337400 NP_001337401 NP_001337402 NP_001337403	NP_001012641 NP_001012642 NP_001012643 NP_444500 NP_898839
Локус (UCSC)	н/д	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIMS1 (англ. Regulating synaptic membrane exocytosis 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 692 амінокислот, а молекулярна маса — 189 073.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSAVGPRGP		RPPTVPPPMQ		ELPDLSHLTE		EERNIIMAVM		DRQKEEEEKE
EAMLKCVVRD		MAKPAACKTP		RNAENQPHQP		SPRLHQQFES		YKEQVRKIGE
EARRYQGEHK		DDAPTCGICH		KTKFADGCGH		LCSYCRTKFC		ARCGGRVSLR
SNNEDKVVMW		VCNLCRKQQE		ILTKSGAWFF		GSGPQQTSQD		GTLSDTATGA
GSEVPREKKA		RLQERSRSQT		PLSTAAASSQ		DAAPPSAPPD		RSKGAEPSQQ
ALGPEQKQAS		SRSRSEPPRE		RKKTPGLSEQ		NGKGALKSER		KRVPKTSAQP
VEGAVEERER		KERRESRRLE		KGRSQDYPDT		PEKRDEGKAA		DEEKQRKEED
YQTRYRSDPN		LARYPVKPPP		EEQQMRMHAR		VSRARHERRH		SDVALPRTEA
GAALPEGKAG		KRAPAAARAS		PPDSPRAYSA		ERTAETRAPG		AKQLTNHSPP
APRHGPVPAE		APELKAQEPL		RKQSRLDPSS		AVLMRKAKRE		KVETMLRNDS
LSSDQSESVR		PSPPKPHRSK		RGGKKRQMSV		SSSEEEGVST		PEYTSCEDVE
LESESVSEKG		DLDYYWLDPA		TWHSRETSPI		SSHPVTWQPS		KEGDRLIGRV
ILNKRTTMPK		DSGALLGLKV		VGGKMTDLGR		LGAFITKVKK		GSLADVVGHL
RAGDEVLEWN		GKPLPGATNE		EVYNIILESK		SEPQVEIIVS		RPIGDIPRIP
ESSHPPLESS		SSSFESQKME		RPSISVISPT		SPGALKDAPQ		VLPGQLSVKL
WYDKVGHQLI		VNVLQATDLP		ARVDGRPRNP		YVKMYFLPDR		SDKSKRRTKT
VKKILEPKWN		QTFVYSHVHR		RDFRERMLEI		TVWDQPRVQE		EESEFLGEIL
IELETALLDD		EPHWYKLQTH		DESSLPLPQP		SPFMPRRHIH		GESSSKKLQR
SQRISDSDIS		DYEVDDGIGV		VPPVGYRSSA		RESKSTTLTV		PEQQRTTHHR
SRSVSPHRGN		DQGKPRSRLP		NVPLQRSLDE		IHPTRRSRSP		TRHHDASRSP
VDHRTRDVDS		QYLSEQDSEL		LMLPRAKRGR		SAECLHTTRH		LVRHYKTLPP
KMPLLQSSSH		WNIYSSILPA		HTKTKSVTRQ		DISLHHECFN		STVLRFTDEI
LVSELQPFLD		RARSASTNCL		RPDTSLHSPE		RERGRWSPSL		DRRRPPSPRI
QIQHASPEND		RHSRKSERSS		IQKQTRKGTA		SDAERVLPTC		LSRRGHAAPR
ATDQPVIRGK		HPARSRSSEH		SSIRTLCSMH		HLVPGGSAPP		SPLLTRMHRQ
RSPTQSPPAD		TSFSSRRGRQ		LPQVPVRSGS		IEQASLVVEE		RTRQMKMKVH
RFKQTTGSGS		SQELDREQYS		KYNIHKDQYR		SCDNVSAKSS		DSDVSDVSAI
SRTSSASRLS		STSFMSEQSE		RPRGRISSFT		PKMQGRRMGT		SGRSIMKSTS
VSGEMYTLEH		NDGSQSDTAV		GTVGAGGKKR		RSSLSAKVVA		IVSRRSRSTS
QLSQTESGHK		KLKSTIQRST		ETGMAAEMRK		MVRQPSREST		DGSINSYSSE
GNLIFPGVRL		GADSQFSDFL		DGLGPAQLVG		RQTLATPAMG		DIQIGMEDKK
GQLEVEVIRA		RSLTQKPGSK		STPAPYVKVY		LLENGACIAK		KKTRIARKTL
DPLYQQSLVF		DESPQGKVLQ		VIVWGDYGRM		DHKCFMGVAQ		ILLEELDLSS
MVIGWYKLFP		PSSLVDPTLT		PLTRRASQSS		LESSTGPPCI		RS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, диференціація клітин, екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6