RIMS2

RIMS2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1V27, 1WFG
Ідентифікатори
Символи	RIMS2, OBOE, RAB3IP3, RIM2, regulating synaptic membrane exocytosis 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606630 MGI: 2152972 HomoloGene: 81639 GeneCards: RIMS2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane transporter binding Клітинна компонента • мембрана • клітинна мембрана • синапс • внутрішньоклітинний • presynaptic active zone • міжклітинні контакти • екзосома • presynaptic membrane • cytoskeleton of presynaptic active zone • presynaptic active zone cytoplasmic component Біологічний процес • диференціація клітин • spontaneous neurotransmitter secretion • positive regulation of inhibitory postsynaptic potential • insulin secretion • regulation of exocytosis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of excitatory postsynaptic potential • positive regulation of dendrite extension • intracellular protein transport • cAMP-mediated signaling • calcium-ion regulated exocytosis • regulation of membrane potential • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of synaptic vesicle exocytosis • екзоцитоз • regulation of synaptic plasticity • positive regulation of synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9699	116838
Ensembl	ENSG00000176406	ENSMUSG00000037386
UniProt	Q9UQ26	Q9EQZ7
RefSeq (мРНК)	NM_001100117 NM_001282881 NM_001282882 NM_014677	NM_001256382 NM_001256383 NM_001256384 NM_053271
RefSeq (білок)	NP_001093587 NP_001269810 NP_001269811 NP_055492 NP_001335413 NP_001335414 NP_001335415 NP_001335416 NP_001335417 NP_001335418 NP_001335419 NP_001335420 NP_001335421 NP_001335422 NP_001335423 NP_001335424 NP_001335425 NP_001335426 NP_001335427 NP_001335428 NP_001335429 NP_001335430 NP_001335431 NP_001335432 NP_001335433 NP_001335434 NP_001335435 NP_001335436 NP_001335437 NP_001335438	NP_001243311 NP_001243312 NP_001243313 NP_444501
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 15: 39.06 – 39.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIMS2 (англ. Regulating synaptic membrane exocytosis 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 411 амінокислот, а молекулярна маса — 160 403.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAPVGPRGR		LAPIPAASQP		PLQPEMPDLS		HLTEEERKII		LAVMDRQKKK
VKEEHKPQLT		QWFPFSGITE		LVNNVLQPQQ		KQQNEKEPQT		KLHQQFEMYK
EQVKKMGEES		QQQQEQKGDA		PTCGICHKTK		FADGCGHNCS		YCQTKFCARC
GGRVSLRSNK		VMWVCNLCRK		QQEILTKSGA		WFYNSGSNTP		QQPDQKVLRG
LRNEEAPQEK		KPKLHEQTQF		QGPSGDLSVP		AVEKSRSHGL		TRQHSIKNGS
GVKHHIASDI		ASDRKRSPSV		SRDQNRRYDQ		REEREEYSQY		ATSDTAMPRS
PSDYADRRSQ		HEPQFYEDSD		HLSYRDSNRR		SHRHSKEYIV		DDEDVESRDE
YERQRREEEY		QSRYRSDPNL		ARYPVKPQPY		EEQMRIHAEV		SRARHERRHS
DVSLANADLE		DSRISMLRMD		RPSRQRSISE		RRAAMENQRS		YSMERTREAQ
GPSSYAQRTT		NHSPPTPRRS		PLPIDRPDLR		RTDSLRKQHH		LDPSSAVRKT
KREKMETMLR		NDSLSSDQSE		SVRPPPPKPH		KSKKGGKMRQ		ISLSSSEEEL
ASTPEYTSCD		DVEIESESVS		EKGDSQKGKR		KTSEQAVLSD		SNTRSERQKE
MMYFGGHSLE		EDLEWSEPQI		KDSGVDTCSS		TTLNEEHSHS		DKHPVTWQPS
KDGDRLIGRI		LLNKRLKDGS		VPRDSGAMLG		LKVVGGKMTE		SGRLCAFITK
VKKGSLADTV		GHLRPGDEVL		EWNGRLLQGA		TFEEVYNIIL		ESKPEPQVEL
VVSRPIGDIP		RIPDSTHAQL		ESSSSSFESQ		KMDRPSISVT		SPMSPGMLRD
VPQFLSGQLS		IKLWFDKVGH		QLIVTILGAK		DLPSREDGRP		RNPYVKIYFL
PDRSDKNKRR		TKTVKKTLEP		KWNQTFIYSP		VHRREFRERM		LEITLWDQAR
VREEESEFLG		EILIELETAL		LDDEPHWYKL		QTHDVSSLPL		PHPSPYMPRR
QLHGESPTRR		LQRSKRISDS		EVSDYDCDDG		IGVVSDYRHD		GRDLQSSTLS
VPEQVMSSNH		CSPSGSPHRV		DVIGRTRSWS		PSVPPPQSRN		VEQGLRGTRT
MTGHYNTISR		MDRHRVMDDH		YSPDRDRDCE		AADRQPYHRS		RSTEQRPLLE
RTTTRSRSTE		RPDTNLMRSM		PSLMTGRSAP		PSPALSRSHP		RTGSVQTSPS
STPVAGRRGR		QLPQLPPKGT		LDRKAGGKKL		RSTVQRSTET		GLAVEMRNWM
TRQASRESTD		GSMNSYSSEG		NLIFPGVRLA		SDSQFSDFLD		GLGPAQLVGR
QTLATPAMGD		IQVGMMDKKG		QLEVEIIRAR		GLVVKPGSKT		LPAPYVKVYL
LDNGVCIAKK		KTKVARKTLE		PLYQQLLSFE		ESPQGKVLQI		IVWGDYGRMD
HKSFMGVAQI		LLDELELSNM		VIGWFKLFPP		SSLVDPTLAP		LTRRASQSSL
ESSTGPSYSR		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang Y., Suedhof T.C. (2003). Genomic definition of RIM proteins: evolutionary amplification of a family of synaptic regulatory proteins. Genomics. 81: 126—137. PMID 12620390 DOI:10.1016/S0888-7543(02)00024-1

Див. також

• Хромосома 8