RIPOR2

RIPOR2
Ідентифікатори
Символи	RIPOR2, C6orf32, DIFF40, DIFF48, MYONAP, PL48, FAM65B, DFNB104, family with sequence similarity 65 member B, RHO family interacting cell polarization regulator 2, DFNA21
Зовнішні ІД	OMIM: 611410 MGI: 2444879 HomoloGene: 9284 GeneCards: RIPOR2
Пов'язані генетичні захворювання
alcohol abuse, autosomal recessive nonsyndromic deafness 104
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 14-3-3 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • cell projection • мембрана • цитоплазма • apical plasma membrane • цитоскелет • Філоподія • stereocilium • stereocilium membrane Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • muscle organ development • слух • skeletal muscle fiber development • positive regulation of myoblast differentiation • positive regulation of myoblast fusion • negative regulation of establishment of T cell polarity • negative regulation of T cell migration • negative regulation of T cell proliferation • regulation of mitotic spindle assembly • хемотаксис • адгезія клітин • negative regulation of signal transduction • negative regulation of cell adhesion • negative regulation of Rho protein signal transduction • positive regulation of filopodium assembly • positive regulation of neutrophil chemotaxis • negative regulation of protein localization to cell leading edge • cellular response to chemokine • regulation of establishment of cell polarity • positive regulation of neutrophil extravasation • negative regulation of Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity • establishment of protein localization • protein homooligomerization • auditory receptor cell stereocilium organization • cellular response to mechanical stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9750	193385
Ensembl	ENSG00000111913	ENSMUSG00000036006
UniProt	Q9Y4F9	Q80U16
RefSeq (мРНК)	NM_001286445 NM_001286446 NM_001286447 NM_014722 NM_015864 NM_001346031 NM_001346032	NM_001080381 NM_001286100 NM_001286101 NM_029679 NM_178658
RefSeq (білок)	NP_001273374 NP_001273375 NP_001273376 NP_001332960 NP_001332961 NP_055537 NP_056948	NP_001073850 NP_001273029 NP_001273030 NP_083955 NP_848773 NP_001389841 NP_001389842 NP_001389843 NP_001389844 NP_001389845 NP_001389846 NP_001389847 NP_001389848
Локус (UCSC)	Хр. 6: 24.8 – 25.04 Mb	Хр. 13: 24.69 – 24.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIPOR2 (англ. RHO family interacting cell polarization regulator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 118 519.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLVGSQSFSP		GGPNGIIRSQ		SFAGFSGLQE		RRSRCNSFIE		NSSALKKPQA
KLKKMHNLGH		KNNNPPKEPQ		PKRVEEVYRA		LKNGLDEYLE		VHQTELDKLT
AQLKDMKRNS		RLGVLYDLDK		QIKTIERYMR		RLEFHISKVD		ELYEAYCIQR
RLQDGASKMK		QAFATSPASK		AARESLTEIN		RSFKEYTENM		CTIEVELENL
LGEFSIKMKG		LAGFARLCPG		DQYEIFMKYG		RQRWKLKGKI		EVNGKQSWDG
EETVFLPLIV		GFISIKVTEL		KGLATHILVG		SVTCETKELF		AARPQVVAVD
INDLGTIKLN		LEITWYPFDV		EDMTASSGAG		NKAAALQRRM		SMYSQGTPET
PTFKDHSFFR		WLHPSPDKPR		RLSVLSALQD		TFFAKLHRSR		SFSDLPSLRP
SPKAVLELYS		NLPDDIFENG		KAAEEKMPLS		LSFSDLPNGD		CALTSHSTGS
PSNSTNPEIT		ITPAEFNLSS		LASQNEGMDD		TSSASSRNSL		GEGQEPKSHL
KEEDPEEPRK		PASAPSEACR		RQSSGAGAEH		LFLENDVAEA		LLQESEEASE
LKPVELDTSE		GNITKQLVKR		LTSAEVPMAT		DRLLSEGSVG		GESEGCRSFL
DGSLEDAFNG		LLLALEPHKE		QYKEFQDLNQ		EVMNLDDILK		CKPAVSRSRS
SSLSLTVESA		LESFDFLNTS		DFDEEEDGDE		VCNVGGGADS		VFSDTETEKH
SYRSVHPEAR		GHLSEALTED		TGVGTSVAGS		PLPLTTGNES		LDITIVRHLQ
YCTQLVQQIV		FSSKTPFVAR		SLLEKLSRQI		QVMEKLAAVS		DENIGNISSV
VEAIPEFHKK		LSLLSFWTKC		CSPVGVYHSP		ADRVMKQLEA		SFARTVNKEY
PGLADPVFRT		LVSQILDRAE		PLLSSSLSSE		VVTVFQYYSY		FTSHGVSDLE
SYLSQLARQV		SMVQTLQSLR		DEKLLQTMSD		LAPSNLLAQQ		EVLRTLALLL
TREDNEVSEA		VTLYLAAASK		NQHFREKALL		YYCEALTKTN		LQLQKAACLA
LKILEATESI		KMLVTLCQSD		TEEIRNVASE		TLLSLGEDGR		LAYEQLDKFP
RDCVKVGGRH		GTEVATAF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів, інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, хемотаксис, диференціація клітин, міогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Dakour J., Li H., Morrish D.W. (1997). PL48: a novel gene associated with cytotrophoblast and lineage-specific HL-60 cell differentiation. Gene. 185: 153—157. PMID 9055809 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00587-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yoon S., Molloy M.J., Wu M.P., Cowan D.B., Gussoni E. (2007). C6ORF32 is upregulated during muscle cell differentiation and induces the formation of cellular filopodia. Dev. Biol. 301: 70—81. PMID 17150207 DOI:10.1016/j.ydbio.2006.11.002
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 6