RNASEH2A

RNASEH2A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3P56, 3PUF
Ідентифікатори
Символи	RNASEH2A, AGS4, JUNB, RNASEHI, RNHIA, RNHL, ribonuclease H2 subunit A, THSD8
Зовнішні ІД	OMIM: 606034 MGI: 1916974 HomoloGene: 4664 GeneCards: RNASEH2A
Пов'язані генетичні захворювання
Aicardi-Goutieres syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • nucleic acid binding • nuclease activity • endonuclease activity • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity • ribonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • ribonuclease H2 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • DNA mismatch repair • реплікація ДНК • Деградація РНК • RNA metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • RNA phosphodiester bond hydrolysis • DNA replication, removal of RNA primer Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10535	69724
Ensembl	ENSG00000104889	ENSMUSG00000052926
UniProt	O75792	Q9CWY8
RefSeq (мРНК)	NM_006397	NM_027187 NM_001364370
RefSeq (білок)	NP_006388	NP_081463 NP_001351299
Локус (UCSC)	Хр. 19: 12.81 – 12.81 Mb	Хр. 8: 85.68 – 85.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNASEH2A (англ. Ribonuclease H2 subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 33 395.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLSELERDN		TGRCRLSSPV		PAVCRKEPCV		LGVDEAGRGP		VLGPMVYAIC
YCPLPRLADL		EALKVADSKT		LLESERERLF		AKMEDTDFVG		WALDVLSPNL
ISTSMLGRVK		YNLNSLSHDT		ATGLIQYALD		QGVNVTQVFV		DTVGMPETYQ
ARLQQSFPGI		EVTVKAKADA		LYPVVSAASI		CAKVARDQAV		KKWQFVEKLQ
DLDTDYGSGY		PNDPKTKAWL		KEHVEPVFGF		PQFVRFSWRT		AQTILEKEAE
DVIWEDSASE		NQEGLRKITS		YFLNEGSQAR		PRSSHRYFLE		RGLESATSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у ядрі.

Література

• Frank P., Braunshofer-Reiter C., Wintersberger U., Grimm R., Buesen W. (1998). Cloning of the cDNA encoding the large subunit of human RNase HI, a homologue of the prokaryotic RNase HII. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 12872—12877. PMID 9789007 DOI:10.1073/pnas.95.22.12872
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19