RNF113A

RNF113A
Ідентифікатори
Символи	RNF113A, Cwc24, RNF113, ZNF183, TTD5, ring finger protein 113A
Зовнішні ІД	OMIM: 300951 MGI: 1913631 HomoloGene: 133824 GeneCards: RNF113A
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • U2-type spliceosomal complex • клітинне ядро • spliceosomal complex • nuclear speck • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA cis splicing, via spliceosome • snoRNA splicing • Убіквітин-залежний протеоліз • isopeptide cross-linking via N6-glycyl-L-lysine • negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway • GO:0100026 Репарація ДНК • mRNA processing • cellular response to DNA damage stimulus • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7737	66381
Ensembl	ENSG00000125352	ENSMUSG00000098134
UniProt	O15541	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_006978	NM_025525
RefSeq (білок)	NP_008909	н/д
Локус (UCSC)	Хр. X: 119.87 – 119.87 Mb	Хр. 12: 84.46 – 84.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF113A (англ. Ring finger protein 113A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот, а молекулярна маса — 38 787.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEQLSPGKA		VDQVCTFLFK		KPGRKGAAGR		RKRPACDPEP		GESGSSSDEG
CTVVRPEKKR		VTHNPMIQKT		RDSGKQKAAY		GDLSSEEEEE		NEPESLGVVY
KSTRSAKPVG		PEDMGATAVY		ELDTEKERDA		QAIFERSQKI		QEELRGKEDD
KIYRGINNYQ		KYMKPKDTSM		GNASSGMVRK		GPIRAPEHLR		ATVRWDYQPD
ICKDYKETGF		CGFGDSCKFL		HDRSDYKHGW		QIERELDEGR		YGVYEDENYE
VGSDDEEIPF		KCFICRQSFQ		NPVVTKCRHY		FCESCALQHF		RTTPRCYVCD
QQTNGVFNPA		KELIAKLEKH		RATGEGGASD		LPEDPDEDAI		PIT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782

Див. також

• Хромосома X