RNF125

RNF125
Ідентифікатори
Символи	RNF125, TRAC-1, TRAC1, TNORS, ring finger protein 125, E3 ubiquitin protein ligase, ring finger protein 125
Зовнішні ІД	OMIM: 610432 HomoloGene: 32369 GeneCards: RNF125
Пов'язані генетичні захворювання
Tenorio syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • zinc ion binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex Біологічний процес • адаптивна імунна відповідь • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • процес імунної системи • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of type I interferon production • negative regulation of RIG-I signaling pathway • protein polyubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54941	361296
Ensembl	ENSG00000101695	ENSRNOG00000057832
UniProt	Q96EQ8	B1WCA3
RefSeq (мРНК)	NM_017831	NM_001108424
RefSeq (білок)	NP_060301	NP_001101894
Локус (UCSC)	Хр. 18: 32.02 – 32.07 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF125 (англ. Ring finger protein 125) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 232 амінокислот, а молекулярна маса — 26 454.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSVLSTDSG		KSAPASATAR		ALERRRDPEL		PVTSFDCAVC		LEVLHQPVRT
RCGHVFCRSC		IATSLKNNKW		TCPYCRAYLP		SEGVPATDVA		KRMKSEYKNC
AECDTLVCLS		EMRAHIRTCQ		KYIDKYGPLQ		ELEETAARCV		CPFCQRELYE
DSLLDHCITH		HRSERRPVFC		PLCRLIPDEN		PSSFSGSLIR		HLQVSHTLFY
DDFIDFNIIE		EALIRRVLDR		SLLEYVNHSN		TT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Giannini A.L., Gao Y., Bijlmakers M.J. (2008). T-cell regulator RNF125/TRAC-1 belongs to a novel family of ubiquitin ligases with zinc fingers and a ubiquitin-binding domain. Biochem. J. 410: 101—111. PMID 17990982 DOI:10.1042/BJ20070995

Див. також

• Хромосома 18