RNF13

RNF13
Ідентифікатори
Символи	RNF13, RZF, ring finger protein 13, EIEE73, DEE73
Зовнішні ІД	OMIM: 609247 MGI: 1346341 HomoloGene: 13493 GeneCards: RNF13
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • lysosomal membrane • Golgi membrane • nuclear inner membrane • ендосома • лізосома • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • late endosome membrane • клітинне ядро • мембрана • Нуклеоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11342	24017
Ensembl	ENSG00000082996	ENSMUSG00000036503
UniProt	O43567	O54965
RefSeq (мРНК)	NM_007282 NM_183381 NM_183382 NM_183383 NM_183384 NM_001378285 NM_001378286 NM_001378287 NM_001378288 NM_001378289 NM_001378290 NM_001378291	NM_001113413 NM_011883 NM_001304454 NM_001304456 NM_001357080
RefSeq (білок)	NP_009213 NP_899237 NP_899239 NP_001365214 NP_001365215 NP_001365216 NP_001365217 NP_001365218 NP_001365219 NP_001365220	NP_001106884 NP_001291383 NP_001291385 NP_036013 NP_001344009
Локус (UCSC)	Хр. 3: 149.81 – 149.96 Mb	Хр. 3: 57.64 – 57.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF13 (англ. Ring finger protein 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 381 амінокислот, а молекулярна маса — 42 814.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLSIGMLML		SATQVYTILT		VQLFAFLNLL		PVEADILAYN		FENASQTFDD
LPARFGYRLP		AEGLKGFLIN		SKPENACEPI		VPPPVKDNSS		GTFIVLIRRL
DCNFDIKVLN		AQRAGYKAAI		VHNVDSDDLI		SMGSNDIEVL		KKIDIPSVFI
GESSANSLKD		EFTYEKGGHL		ILVPEFSLPL		EYYLIPFLII		VGICLILIVI
FMITKFVQDR		HRARRNRLRK		DQLKKLPVHK		FKKGDEYDVC		AICLDEYEDG
DKLRILPCSH		AYHCKCVDPW		LTKTKKTCPV		CKQKVVPSQG		DSDSDTDSSQ
EENEVTEHTP		LLRPLASVSA		QSFGALSESR		SHQNMTESSD		YEEDDNEDTD
SSDAENEINE		HDVVVQLQPN		GERDYNIANT		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Q., Meng Y., Zhang L., Chen J., Zhu D. (2009). RNF13: a novel RING-type ubiquitin ligase over-expressed in pancreatic cancer. Cell Res. 19: 348—357. PMID 18794910 DOI:10.1038/cr.2008.285
• Lomax M.I., Warner S.J., Bersirli C.G., Gong T.-W.L. (1998). The gene for a RING zinc finger protein is expressed in the inner chick ear after noise exposure. Prim. Sens. Neuron. 2: 305—316.

Див. також

• Хромосома 3