RNF146

RNF146
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D8T, 3V3L
Ідентифікатори
Символи	RNF146, dJ351K20.1, ring finger protein 146
Зовнішні ІД	OMIM: 612137 MGI: 1915281 HomoloGene: 12227 GeneCards: RNF146
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • poly-ADP-D-ribose binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein K48-linked ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81847	68031
Ensembl	ENSG00000118518	ENSMUSG00000038876
UniProt	Q9NTX7	Q9CZW6
RefSeq (мРНК)	NM_001242844 NM_001242845 NM_001242846 NM_001242847 NM_001242848 NM_001242849 NM_001242850 NM_001242851 NM_001242852 NM_030963	NM_001110196 NM_001110197 NM_001110198 NM_001284279 NM_026518
RefSeq (білок)	NP_001229773 NP_001229774 NP_001229775 NP_001229776 NP_001229777 NP_001229778 NP_001229779 NP_001229780 NP_001229781 NP_112225	NP_001103666 NP_001103667 NP_001103668 NP_001271208 NP_080794
Локус (UCSC)	Хр. 6: 127.27 – 127.29 Mb	Хр. 10: 29.22 – 29.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF146 (англ. Ring finger protein 146) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 38 950.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMAGCGEIDH		SINMLPTNRK		ANESCSNTAP		SLTVPECAIC		LQTCVHPVSL
PCKHVFCYLC		VKGASWLGKR		CALCRQEIPE		DFLDKPTLLS		PEELKAASRG
NGEYAWYYEG		RNGWWQYDER		TSRELEDAFS		KGKKNTEMLI		AGFLYVADLE
NMVQYRRNEH		GRRRKIKRDI		IDIPKKGVAG		LRLDCDANTV		NLARESSADG
ADSVSAQSGA		SVQPLVSSVR		PLTSVDGQLT		SPATPSPDAS		TSLEDSFAHL
QLSGDNTAER		SHRGEGEEDH		ESPSSGRVPA		PDTSIEETES		DASSDSEDVS
AVVAQHSLTQ		QRLLVSNANQ		TVPDRSDRSG		TDRSVAGGGT		VSVSVRSRRP
DGQCTVTEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• von Rotz R.C., Kins S., Hipfel R., von der Kammer H., Nitsch R.M. (2005). The novel cytosolic RING finger protein dactylidin is up-regulated in brains of patients with Alzheimer's disease. Eur. J. Neurosci. 21: 1289—1298. PMID 15813938 DOI:10.1111/j.1460-9568.2005.03977.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Menachem T.D., Laitman Y., Kaufman B., Friedman E. (2009). The RNF146 and ECHDC1 genes as candidates for inherited breast and ovarian cancer in Jewish Ashkenazi women. Fam. Cancer. 8: 399—402. PMID 19517271 DOI:10.1007/s10689-009-9255-7

Див. також

• Хромосома 6