RNF20

RNF20
Ідентифікатори
Символи	RNF20, BRE1, BRE1A, hBRE1, ring finger protein 20
Зовнішні ІД	OMIM: 607699 MGI: 1925927 HomoloGene: 5571 GeneCards: RNF20
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0031493 histone binding • p53 binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • mRNA 3'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity Клітинна компонента • ubiquitin ligase complex • HULC complex • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of mRNA polyadenylation • positive regulation of histone methylation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell migration • regulation of mitotic cell cycle • histone H2B ubiquitination • positive regulation of histone H2B ubiquitination • histone ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • histone monoubiquitination • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56254	109331
Ensembl	ENSG00000155827	ENSMUSG00000028309
UniProt	Q5VTR2	Q5DTM8
RefSeq (мРНК)	NM_019592	NM_001163263 NM_182999 NM_001356401
RefSeq (білок)	NP_062538	NP_001156735 NP_892044 NP_001343330
Локус (UCSC)	Хр. 9: 101.53 – 101.56 Mb	Хр. 4: 49.63 – 49.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF20 (англ. Ring finger protein 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 113 662.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGIGNKRAA		GEPGTSMPPE		KKAAVEDSGT		TVETIKLGGV		SSTEELDIRT
LQTKNRKLAE		MLDQRQAIED		ELREHIEKLE		RRQATDDASL		LIVNRYWSQF
DENIRIILKR		YDLEQGLGDL		LTERKALVVP		EPEPDSDSNQ		ERKDDRERGE
GQEPAFSFLA		TLASSSSEEM		ESQLQERVES		SRRAVSQIVT		VYDKLQEKVE
LLSRKLNSGD		NLIVEEAVQE		LNSFLAQENM		RLQELTDLLQ		EKHRTMSQEF
SKLQSKVETA		ESRVSVLESM		IDDLQWDIDK		IRKREQRLNR		HLAEVLERVN
SKGYKVYGAG		SSLYGGTITI		NARKFEEMNA		ELEENKELAQ		NRLCELEKLR
QDFEEVTTQN		EKLKVELRSA		VEQVVKETPE		YRCMQSQFSV		LYNESLQLKA
HLDEARTLLH		GTRGTHQHQV		ELIERDEVSL		HKKLRTEVIQ		LEDTLAQVRK
EYEMLRIEFE		QTLAANEQAG		PINREMRHLI		SSLQNHNHQL		KGEVLRYKRK
LREAQSDLNK		TRLRSGSALL		QSQSSTEDPK		DEPAELKPDS		EDLSSQSSAS
KASQEDANEI		KSKRDEEERE		RERREKERER		EREREKEKER		EREKQKLKES
EKERDSAKDK		EKGKHDDGRK		KEAEIIKQLK		IELKKAQESQ		KEMKLLLDMY
RSAPKEQRDK		VQLMAAEKKS		KAELEDLRQR		LKDLEDKEKK		ENKKMADEDA
LRKIRAVEEQ		IEYLQKKLAM		AKQEEEALLS		EMDVTGQAFE		DMQEQNIRLM
QQLREKDDAN		FKLMSERIKS		NQIHKLLKEE		KEELADQVLT		LKTQVDAQLQ
VVRKLEEKEH		LLQSNIGTGE		KELGLRTQAL		EMNKRKAMEA		AQLADDLKAQ
LELAQKKLHD		FQDEIVENSV		TKEKDMFNFK		RAQEDISRLR		RKLETTKKPD
NVPKCDEILM		EEIKDYKARL		TCPCCNMRKK		DAVLTKCFHV		FCFECVKTRY
DTRQRKCPKC		NAAFGANDFH		RIYIG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim J., Hake S.B., Roeder R.G. (2005). The human homolog of yeast BRE1 functions as a transcriptional coactivator through direct activator interactions. Mol. Cell. 20: 759—770. PMID 16337599 DOI:10.1016/j.molcel.2005.11.012
• Zhang F., Yu X. (2011). WAC, a functional partner of RNF20/40, regulates histone H2B ubiquitination and gene transcription. Mol. Cell. 41: 384—397. PMID 21329877 DOI:10.1016/j.molcel.2011.01.024

Див. також

• Хромосома 9