RNF216

RNF216
Ідентифікатори
Символи	RNF216, CAHH, TRIAD3, U7I1, UBCE7IP1, ZIN, ring finger protein 216
Зовнішні ІД	OMIM: 609948 MGI: 1344349 HomoloGene: 19442 GeneCards: RNF216
Пов'язані генетичні захворювання
Gordon-Holmes syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • Schaffer collateral - CA1 synapse • postsynaptic endocytic zone • glutamatergic synapse Біологічний процес • protein K48-linked ubiquitination • negative regulation of type I interferon production • GO:0022415 viral process • regulation of interferon-beta production • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of defense response to virus by host • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0097285 апоптоз • protein catabolic process, modulating synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54476	108086
Ensembl	ENSG00000011275	ENSMUSG00000045078
UniProt	Q9NWF9	P58283
RefSeq (мРНК)	NM_019011 NM_207111 NM_207116 NM_001377156	NM_080561 NM_207110 NM_001359851
RefSeq (білок)	NP_996994 NP_996999 NP_001364085	NP_542128 NP_996993 NP_001346780
Локус (UCSC)	Хр. 7: 5.62 – 5.78 Mb	Хр. 5: 142.98 – 143.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF216 (англ. Ring finger protein 216) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 866 амінокислот, а молекулярна маса — 99 406.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEGNNNEEV		IHLNNFHCHR		GQEWINLRDG		PITISDSSDE		ERIPMLVTPA
PQQHEEEDLD		DDVILTEDDS		EDDYGEFLDL		GPPGISEFTK		PSGQTEREPK
PGPSHNQAAN		DIVNPRSEQK		VIILEEGSLL		YTESDPLETQ		NQSSEDSETE
LLSNLGESAA		LADDQAIEED		CWLDHPYFQS		LNQQPREITN		QVVPQERQPE
AELGRLLFQH		EFPGPAFPRP		EPQQGGISGP		SSPQPAHPLG		EFEDQQLASD
DEEPGPAFPM		QESQEPNLEN		IWGQEAAEVD		QELVELLVKE		TEARFPDVAN
GFIEEIIHFK		NYYDLNVLCN		FLLENPDYPK		REDRIIINPS		SSLLASQDET
KLPKIDFFDY		SKLTPLDQRC		FIQAADLLMA		DFKVLSSQDI		KWALHELKGH
YAITRKALSD		AIKKWQELSP		ETSGKRKKRK		QMNQYSYIDF		KFEQGDIKIE
KRMFFLENKR		RHCRSYDRRA		LLPAVQQEQE		FYEQKIKEMA		EHEDFLLALQ
MNEEQYQKDG		QLIECRCCYG		EFPFEELTQC		ADAHLFCKEC		LIRYAQEAVF
GSGKLELSCM		EGSCTCSFPT		SELEKVLPQT		ILYKYYERKA		EEEVAAAYAD
ELVRCPSCSF		PALLDSDVKR		FSCPNPHCRK		ETCRKCQGLW		KEHNGLTCEE
LAEKDDIKYR		TSIEEKMTAA		RIRKCHKCGT		GLIKSEGCNR		MSCRCGAQMC
YLCRVSINGY		DHFCQHPRSP		GAPCQECSRC		SLWTDPTEDD		EKLIEEIQKE
AEEEQKRKNG		ENTFKRIGPP		LEKPVEKVQR		VEALPRPVPQ		NLPQPQMPPY
AFAHPPFPLP		PVRPVFNNFP		LNMGPIPAPY		VPPLPNVRVN		YDFGPIHMPL
EHNLPMHFGP		QPRHRF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Chen D., Li X., Zhai Z., Shu H.-B. (2002). A novel zinc finger protein interacts with receptor-interacting protein (RIP) and inhibits tumor necrosis factor (TNF)- and IL1-induced NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 277: 15985—15991. PMID 11854271 DOI:10.1074/jbc.M108675200
• Chuang T.-H., Ulevitch R.J. (2004). Triad3A, an E3 ubiquitin-protein ligase regulating Toll-like receptors. Nat. Immunol. 5: 495—502. PMID 15107846 DOI:10.1038/ni1066
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 7