RNF34

RNF34
Ідентифікатори
Символи	RNF34, CARP-1, CARP1, RFI, RIF, RIFF, hRFI, ring finger protein 34
Зовнішні ІД	OMIM: 608299 MGI: 2153340 HomoloGene: 11839 GeneCards: RNF34
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol phosphate binding • p53 binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • система ендомембран • клітинне ядро • мембрана • клітинна мембрана • nuclear speck • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • negative regulation of signal transduction by p53 class mediator • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor signaling pathway • protein K48-linked ubiquitination • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • GO:0097285 апоптоз • regulation of oxygen metabolic process • cellular response to cold • Убіквітин-залежний протеоліз • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80196	80751
Ensembl	ENSG00000170633	ENSMUSG00000029474
UniProt	Q969K3	Q99KR6
RefSeq (мРНК)	NM_194271 NM_001256858 NM_025126 NM_001394208	NM_030564
RefSeq (білок)	NP_001243787 NP_079402 NP_919247	NP_085041
Локус (UCSC)	Хр. 12: 121.4 – 121.43 Mb	Хр. 5: 122.99 – 123.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF34 (англ. Ring finger protein 34) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 41 641.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKAGATSMWA		SCCGLLNEVM		GTGAVRGQQS		AFAGATGPFR		FTPNPEFSTY
PPAATEGPNI		VCKACGLSFS		VFRKKHVCCD		CKKDFCSVCS		VLQENLRRCS
TCHLLQETAF		QRPQLMRLKV		KDLRQYLILR		NIPIDTCREK		EDLVDLVLCH
HGLGSEDDMD		TSSLNSSRSQ		TSSFFTRSFF		SNYTAPSATM		SSFQGELMDG
DQTSRSGVPA		QVQSEITSAN		TEDDDDDDDE		DDDDEEENAE		DRNPGLSKER
VRASLSDLSS		LDDVEGMSVR		QLKEILARNF		VNYSGCCEKW		ELVEKVNRLY
KENEENQKSY		GERLQLQDEE		DDSLCRICMD		AVIDCVLLEC		GHMVTCTKCG
KRMSECPICR		QYVVRAVHVF		KS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McDonald E.R. III, El-Deiry W.S. (2004). Suppression of caspase-8- and -10-associated RING proteins results in sensitization to death ligands and inhibition of tumor cell growth. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6170—6175. PMID 15069192 DOI:10.1073/pnas.0307459101
• Konishi T., Sasaki S., Watanabe T., Kitayama J., Nagawa H. (2005). Overexpression of hRFI (human RING finger homologous to inhibitor of apoptosis protein type) inhibits death receptor-mediated apoptosis in colorectal cancer cells. Mol. Cancer Ther. 4: 743—750. PMID 15897238 DOI:10.1158/1535-7163.MCT-05-0020
• Yang W., Dicker D.T., Chen J., El-Deiry W.S. (2008). CARPs enhance p53 turnover by degrading 14-3-3sigma and stabilizing MDM2. Cell Cycle. 7: 670—682. PMID 18382127 DOI:10.4161/cc.7.5.5701
• Wei P., Pan D., Mao C., Wang Y.X. (2012). RNF34 is a cold-regulated E3 ubiquitin ligase for PGC-1alpha and modulates brown fat cell metabolism. Mol. Cell. Biol. 32: 266—275. PMID 22064484 DOI:10.1128/MCB.05674-11

Див. також

• Хромосома 12