RNF40

RNF40
Ідентифікатори
Символи	RNF40, BRE1B, RBP95, STARING, ring finger protein 40
Зовнішні ІД	OMIM: 607700 MGI: 2142048 HomoloGene: 8856 GeneCards: RNF40
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0032403 protein-containing complex binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • syntaxin-1 binding • protein homodimerization activity • mRNA 3'-UTR binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • axon terminus • гіалоплазма • мембрана • HULC complex • extrinsic component of membrane • ubiquitin ligase complex • клітинне ядро • neuron projection • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • negative regulation of mRNA polyadenylation • histone H2B ubiquitination • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • response to peptide hormone • regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of protein polyubiquitination • histone monoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of histone H2B ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9810	233900
Ensembl	ENSG00000103549	ENSMUSG00000030816
UniProt	O75150	Q3U319
RefSeq (мРНК)	NM_001207033 NM_001207034 NM_001286572 NM_014771 NM_194352	NM_172281 NM_001360883
RefSeq (білок)	NP_001193962 NP_001193963 NP_001273501 NP_055586	NP_758485 NP_001347812
Локус (UCSC)	Хр. 16: 30.76 – 30.78 Mb	Хр. 7: 127.19 – 127.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF40 (англ. Ring finger protein 40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 001 амінокислот, а молекулярна маса — 113 650.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGPGNKRAA		GDGGSGPPEK		KLSREEKTTT		TLIEPIRLGG		ISSTEEMDLK
VLQFKNKKLA		ERLEQRQACE		DELRERIEKL		EKRQATDDAT		LLIVNRYWAQ
LDETVEALLR		CHESQGELSS		APEAPGTQEG		PTCDGTPLPE		PGTSELRDPL
LMQLRPPLSE		PALAFVVALG		ASSSEEVELE		LQGRMEFSKA		AVSRVVEASD
RLQRRVEELC		QRVYSRGDSE		PLSEAAQAHT		RELGRENRRL		QDLATQLQEK
HHRISLEYSE		LQDKVTSAET		KVLEMETTVE		DLQWDIEKLR		KREQKLNKHL
AEALEQLNSG		YYVSGSSSGF		QGGQITLSMQ		KFEMLNAELE		ENQELANSRM
AELEKLQAEL		QGAVRTNERL		KVALRSLPEE		VVRETGEYRM		LQAQFSLLYN
ESLQVKTQLD		EARGLLLATK		NSHLRHIEHM		ESDELGLQKK		LRTEVIQLED
TLAQVRKEYE		MLRIEFEQNL		AANEQAGPIN		REMRHLISSL		QNHNHQLKGD
AQRYKRKLRE		VQAEIGKLRA		QASGSAHSTP		NLGHPEDSGV		SAPAPGKEEG
GPGPVSTPDN		RKEMAPVPGT		TTTTTSVKKE		ELVPSEEDFQ		GITPGAQGPS
SRGREPEARP		KRELQEREGP		SLGPPPVASA		LSRADREKAK		VEETKRKESE
LLKGLRAELK		KAQESQKEMK		LLLDMYKSAP		KEQRDKVQLM		AAERKAKAEV
DELRSRIREL		EERDRRESKK		IADEDALRRI		RQAEEQIEHL		QRKLGATKQE
EEALLSEMDV		TGQAFEDMQE		QNGRLLQQLR		EKDDANFKLM		SERIKANQIH
KLLREEKDEL		GEQVLGLKSQ		VDAQLLTVQK		LEEKERALQG		SLGGVEKELT
LRSQALELNK		RKAVEAAQLA		EDLKVQLEHV		QTRLREIQPC		LAESRAAREK
ESFNLKRAQE		DISRLRRKLE		KQRKVEVYAD		ADEILQEEIK		EYKARLTCPC
CNTRKKDAVL		TKCFHVFCFE		CVRGRYEARQ		RKCPKCNAAF		GAHDFHRIYI
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Wen H., Ao S. (2000). RBP95, a novel leucine zipper protein, binds to the retinoblastoma protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 141—148. PMID 10944455 DOI:10.1006/bbrc.2000.3242
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang F., Yu X. (2011). WAC, a functional partner of RNF20/40, regulates histone H2B ubiquitination and gene transcription. Mol. Cell. 41: 384—397. PMID 21329877 DOI:10.1016/j.molcel.2011.01.024

Див. також

• Хромосома 16