RNF43

RNF43
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4KNG
Ідентифікатори
Символи	RNF43, RNF124, URCC, ring finger protein 43, SSPCS
Зовнішні ІД	OMIM: 612482 MGI: 2442609 HomoloGene: 37742 GeneCards: RNF43
Пов'язані генетичні захворювання
рак підшлункової залози
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005110 frizzled binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • nuclear envelope • endoplasmic reticulum membrane • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • negative regulation of Wnt signaling pathway • Wnt signaling pathway • Wnt receptor catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • stem cell proliferation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • multicellular organism development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54894	207742
Ensembl	ENSG00000108375	ENSMUSG00000034177
UniProt	Q68DV7	Q5NCP0
RefSeq (мРНК)	NM_001305544 NM_001305545 NM_017763	NM_172448 NM_001363437
RefSeq (білок)	NP_001292473 NP_001292474 NP_060233	NP_766036 NP_001350366
Локус (UCSC)	Хр. 17: 58.35 – 58.42 Mb	Хр. 11: 87.55 – 87.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF43 (англ. Ring finger protein 43) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 783 амінокислот, а молекулярна маса — 85 722.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGGHQLQLA		ALWPWLLMAT		LQAGFGRTGL		VLAAAVESER		SAEQKAIIRV
IPLKMDPTGK		LNLTLEGVFA		GVAEITPAEG		KLMQSHPLYL		CNASDDDNLE
PGFISIVKLE		SPRRAPRPCL		SLASKARMAG		ERGASAVLFD		ITEDRAAAEQ
LQQPLGLTWP		VVLIWGNDAE		KLMEFVYKNQ		KAHVRIELKE		PPAWPDYDVW
ILMTVVGTIF		VIILASVLRI		RCRPRHSRPD		PLQQRTAWAI		SQLATRRYQA
SCRQARGEWP		DSGSSCSSAP		VCAICLEEFS		EGQELRVISC		LHEFHRNCVD
PWLHQHRTCP		LCMFNITEGD		SFSQSLGPSR		SYQEPGRRLH		LIRQHPGHAH
YHLPAAYLLG		PSRSAVARPP		RPGPFLPSQE		PGMGPRHHRF		PRAAHPRAPG
EQQRLAGAQH		PYAQGWGLSH		LQSTSQHPAA		CPVPLRRARP		PDSSGSGESY
CTERSGYLAD		GPASDSSSGP		CHGSSSDSVV		NCTDISLQGV		HGSSSTFCSS
LSSDFDPLVY		CSPKGDPQRV		DMQPSVTSRP		RSLDSVVPTG		ETQVSSHVHY
HRHRHHHYKK		RFQWHGRKPG		PETGVPQSRP		PIPRTQPQPE		PPSPDQQVTR
SNSAAPSGRL		SNPQCPRALP		EPAPGPVDAS		SICPSTSSLF		NLQKSSLSAR
HPQRKRRGGP		SEPTPGSRPQ		DATVHPACQI		FPHYTPSVAY		PWSPEAHPLI
CGPPGLDKRL		LPETPGPCYS		NSQPVWLCLT		PRQPLEPHPP		GEGPSEWSSD
TAEGRPCPYP		HCQVLSAQPG		SEEELEELCE		QAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sugiura T., Yamaguchi A., Miyamoto K. (2008). A cancer-associated RING finger protein, RNF43, is a ubiquitin ligase that interacts with a nuclear protein, HAP95. Exp. Cell Res. 314: 1519—1528. PMID 18313049 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.01.013
• Miyamoto K., Sakurai H., Sugiura T. (2008). Proteomic identification of a PSF/p54nrb heterodimer as RNF43 oncoprotein-interacting proteins. Proteomics. 8: 2907—2910. PMID 18655028 DOI:10.1002/pmic.200800083
• Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 DOI:10.1101/gad.219915.113

Див. також

• Хромосома 17