RSAD2

RSAD2
Ідентифікатори
Символи	RSAD2, 2510004L01Rik, cig33, cig5, vig1, radical S-adenosyl methionine domain containing 2, Viperin Protein, Viperin
Зовнішні ІД	OMIM: 607810 MGI: 1929628 HomoloGene: 10969 GeneCards: RSAD2
Онтологія гена Молекулярна функція • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • iron-sulfur cluster binding • зв'язування з іоном металу • protein self-association • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • lipid droplet • мітохондріальна зовнішня мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • fibrillar center Біологічний процес • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • CD4-positive, alpha-beta T cell activation • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of toll-like receptor 7 signaling pathway • negative regulation of viral genome replication • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • positive regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production • negative regulation of protein secretion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91543	58185
Ensembl	ENSG00000134321	ENSMUSG00000020641
UniProt	Q8WXG1	Q8CBB9
RefSeq (мРНК)	NM_080657	NM_021384
RefSeq (білок)	NP_542388	NP_067359
Локус (UCSC)	Хр. 2: 6.87 – 6.9 Mb	Хр. 12: 26.49 – 26.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RSAD2 (англ. Radical S-adenosyl methionine domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 42 170.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWVLTPAAFA		GKLLSVFRQP		LSSLWRSLVP		LFCWLRATFW		LLATKRRKQQ
LVLRGPDETK		EEEEDPPLPT		TPTSVNYHFT		RQCNYKCGFC		FHTAKTSFVL
PLEEAKRGLL		LLKEAGMEKI		NFSGGEPFLQ		DRGEYLGKLV		RFCKVELRLP
SVSIVSNGSL		IRERWFQNYG		EYLDILAISC		DSFDEEVNVL		IGRGQGKKNH
VENLQKLRRW		CRDYRVAFKI		NSVINRFNVE		EDMTEQIKAL		NPVRWKVFQC
LLIEGENCGE		DALREAERFV		IGDEEFERFL		ERHKEVSCLV		PESNQKMKDS
YLILDEYMRF		LNCRKGRKDP		SKSILDVGVE		EAIKFSGFDE		KMFLKRGGKY
IWSKADLKLD		W

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, групою 4fe-4s, залізо-сірчаною групою, s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, ліпідних краплях, зовнішній мембрані мітохондрій, апараті гольджі.

Література

• Zhu H., Cong J.-P., Shenk T. (1997). Use of differential display analysis to assess the effect of human cytomegalovirus infection on the accumulation of cellular RNAs: induction of interferon-responsive RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 13985—13990. PMID 9391139 DOI:10.1073/pnas.94.25.13985
• Chin K.-C., Cresswell P. (2001). Viperin (cig5), an IFN-inducible antiviral protein directly induced by human cytomegalovirus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 15125—15130. PMID 11752458 DOI:10.1073/pnas.011593298
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Helbig K.J., Lau D.T.-Y., Semendric L., Harley H.A.J., Beard M.R. (2005). Analysis of ISG expression in chronic hepatitis C identifies viperin as a potential antiviral effector. Hepatology. 42: 702—710. PMID 16108059 DOI:10.1002/hep.20844
• Khaiboullina S.F., Rizvanov A.A., Holbrook M.R., St Jeor S. (2005). Yellow fever virus strains Asibi and 17D-204 infect human umbilical cord endothelial cells and induce novel changes in gene expression. Virology. 342: 167—176. PMID 16150475 DOI:10.1016/j.virol.2005.07.035
• Severa M., Coccia E.M., Fitzgerald K.A. (2006). Toll-like receptor-dependent and -independent viperin gene expression and counter-regulation by PRDI-binding factor-1/BLIMP1. J. Biol. Chem. 281: 26188—26195. PMID 16849320 DOI:10.1074/jbc.M604516200

Див. також

• Хромосома 2