RUBCN

RUBCN
Ідентифікатори
Символи	RUBCN, RUBICON, SCAR15, KIAA0226, RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, rubicon autophagy regulator
Зовнішні ІД	OMIM: 613516 MGI: 1915160 HomoloGene: 15687 GeneCards: RUBCN
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive spinocerebellar ataxia 15
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • ендосома • late endosome • лізосома • комплекс Ґольджі • early endosome • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • Фагоцитоз • автофагія • negative regulation of endocytosis • negative regulation of autophagy • ендоцитоз • multivesicular body sorting pathway • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • процес імунної системи • negative regulation of autophagosome maturation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9711	100502698
Ensembl	ENSG00000145016	ENSMUSG00000035629
UniProt	Q92622	Q80U62
RefSeq (мРНК)	NM_001145642 NM_014687 NM_001346873	NM_001200038 NM_172615 NM_001374776
RefSeq (білок)	NP_001139114 NP_001333802 NP_055502	NP_001186967 NP_766203 NP_001361705
Локус (UCSC)	Хр. 3: 197.67 – 197.75 Mb	Хр. 16: 32.64 – 32.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RUBCN (англ. RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 972 амінокислот, а молекулярна маса — 108 622.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPEGAGMEL		GGGEERLPEE		SRREHWQLLG		NLKTTVEGLV		STNSPNVWSK
YGGLERLCRD		MQSILYHGLI		RDQACRRQTD		YWQFVKDIRW		LSPHSALHVE
KFISVHENDQ		SSADGASERA		VAELWLQHSL		QYHCLSAQLR		PLLGDRQYIR
KFYTDAAFLL		SDAHVTAMLQ		CLEAVEQNNP		RLLAQIDASM		FARKHESPLL
VTKSQSLTAL		PSSTYTPPNS		YAQHSYFGSF		SSLHQSVPNN		GSERRSTSFP
LSGPPRKPQE		SRGHVSPAED		QTIQAPPVSV		SALARDSPLT		PNEMSSSTLT
SPIEASWVSS		QNDSPGDASE		GPEYLAIGNL		DPRGRTASCQ		SHSSNAESSS
SNLFSSSSSQ		KPDSAASSLG		DQEGGGESQL		SSVLRRSSFS		EGQTLTVTSG
AKKSHIRSHS		DTSIASRGAP		ESCNDKAKLR		GPLPYSGQSS		EVSTPSSLYM
EYEGGRYLCS		GEGMFRRPSE		GQSLISYLSE		QDFGSCADLE		KENAHFSISE
SLIAAIELMK		CNMMSQCLEE		EEVEEEDSDR		EIQELKQKIR		LRRQQIRTKN
LLPMYQEAEH		GSFRVTSSSS		QFSSRDSAQL		SDSGSADEVD		EFEIQDADIR
RNTASSSKSF		VSSQSFSHCF		LHSTSAEAVA		MGLLKQFEGM		QLPAASELEW
LVPEHDAPQK		LLPIPDSLPI		SPDDGQHADI		YKLRIRVRGN		LEWAPPRPQI
IFNVHPAPTR		KIAVAKQNYR		CAGCGIRTDP		DYIKRLRYCE		YLGKYFCQCC
HENAQMAIPS		RVLRKWDFSK		YYVSNFSKDL		LIKIWNDPLF		NVQDINSALY
RKVKLLNQVR		LLRVQLCHMK		NMFKTCRLAK		ELLDSFDTVP		GHLTEDLHLY
SLNDLTATRK		GELGPRLAEL		TRAGATHVER		CMLCQAKGFI		CEFCQNEDDI
IFPFELHKCR		TCEECKACYH		KACFKSGSCP		RCERLQARRE		ALARQSLESY
LSDYEEEPAE		ALALEAAVLE		AT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, ендоцитоз, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у лізосомі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sun Q., Westphal W., Wong K.N., Tan I., Zhong Q. (2010). Rubicon controls endosome maturation as a Rab7 effector. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 19338—19343. PMID 20974968 DOI:10.1073/pnas.1010554107

Див. також

• Хромосома 3