RUFY3

RUFY3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CXF, 2CXL, 2DWG, 2DWK
Ідентифікатори
Символи	RUFY3, RIPX, SINGAR1, ZFYVE30, RUN and FYVE domain containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 611194 MGI: 106484 HomoloGene: 87809 GeneCards: RUFY3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • перикаріон • cell projection • мембрана • Філоподія • growth cone • аксон • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • система ендомембран • lamellipodium • гіалоплазма • soma Біологічний процес • positive regulation of intracellular protein transport • диференціація клітин • actin filament organization • positive regulation of cell migration • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • negative regulation of axonogenesis • positive regulation of axon extension • regulation of establishment of cell polarity • regulation of axonogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22902	52822
Ensembl	ENSG00000018189	ENSMUSG00000029291
UniProt	Q7L099	Q9D394
RefSeq (мРНК)	NM_001037442 NM_001130709 NM_001291993 NM_001291994 NM_014961 NM_001345840	NM_001289774 NM_001289775 NM_001289776 NM_001289777 NM_027530 NM_001359208 NM_001359209
RefSeq (білок)	NP_001032519 NP_001124181 NP_001278922 NP_001278923 NP_001332769 NP_055776	NP_001276703 NP_001276704 NP_001276705 NP_001276706 NP_081806 NP_001346137 NP_001346138
Локус (UCSC)	Хр. 4: 70.7 – 70.81 Mb	Хр. 5: 88.71 – 88.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RUFY3 (англ. RUN and FYVE domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 52 965.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSALTPPTDM		PTPTTDKITQ		AAMETIYLCK		FRVSMDGEWL		CLRELDDISL
TPDPEPTHED		PNYLMANERM		NLMNMAKLSI		KGLIESALNL		GRTLDSDYAP
LQQFFVVMEH		CLKHGLKAKK		TFLGQNKSFW		GPLELVEKLV		PEAAEITASV
KDLPGLKTPV		GRGRAWLRLA		LMQKKLSEYM		KALINKKELL		SEFYEPNALM
MEEEGAIIAG		LLVGLNVIDA		NFCMKGEDLD		SQVGVIDFSM		YLKDGNSSKG
TEGDGQITAI		LDQKNYVEEL		NRHLNATVNN		LQAKVDALEK		SNTKLTEELA
VANNRIITLQ		EEMERVKEES		SYILESNRKG		PKQDRTAEGQ		ALSEARKHLK
EETQLRLDVE		KELEMQISMR		QEMELAMKML		EKDVCEKQDA		LVSLRQQLDD
LRALKHELAF		KLQSSDLGVK		QKSELNSRLE		EKTNQMAATI		KQLEQSEKDL
VKQAKTLNSA		ANKLIPKHH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yoshida H., Okumura N., Kitagishi Y., Shirafuji N., Matsuda S. (2010). Rab5(Q79L) interacts with the carboxyl terminus of RUFY3. Int. J. Biol. Sci. 6: 187—189. PMID 20376209 DOI:10.7150/ijbs.6.187

Див. також

• Хромосома 4