SAMSN1

SAMSN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KEA
Ідентифікатори
Символи	SAMSN1, HACS1, NASH1, SASH2, SH3D6B, SLy2, SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607978 MGI: 1914992 HomoloGene: 11148 GeneCards: SAMSN1
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphotyrosine residue binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • ruffle • гіалоплазма • cell projection • клітинне ядро • клітинна мембрана Біологічний процес • negative regulation of B cell activation • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of adaptive immune response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64092	67742
Ensembl	ENSG00000155307	ENSMUSG00000022876
UniProt	Q9NSI8	P57725
RefSeq (мРНК)	NM_001256370 NM_001286523 NM_022136	NM_023380
RefSeq (білок)	NP_001243299 NP_001273452 NP_071419	NP_075869
Локус (UCSC)	Хр. 21: 14.49 – 14.66 Mb	Хр. 16: 75.66 – 75.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SAMSN1 (англ. SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 41 708.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLKRKPSNVS		EKEKHQKPKR		SSSFGNFDRF		RNNSLSKPDD		STEAHEGDPT
NGSGEQSKTS		NNGGGLGKKM		RAISWTMKKK		VGKKYIKALS		EEKDEEDGEN
AHPYRNSDPV		IGTHTEKVSL		KASDSMDSLY		SGQSSSSGIT		SCSDGTSNRD
SFRLDDDGPY		SGPFCGRARV		HTDFTPSPYD		TDSLKIKKGD		IIDIICKTPM
GMWTGMLNNK		VGNFKFIYVD		VISEEEAAPK		KIKANRRSNS		KKSKTLQEFL
ERIHLQEYTS		TLLLNGYETL		EDLKDIKESH		LIELNIENPD		DRRRLLSAAE
NFLEEEIIQE		QENEPEPLSL		SSDISLNKSQ		LDDCPRDSGC		YISSGNSDNG
KEDLESENLS		DMVHKIIITE		PSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53

Див. також

• Хромосома 21