SCGN

SCGN
Ідентифікатори
Символи	SCGN, CALBL, DJ501N12.8, SECRET, SEGN, setagin, secretagogin, EF-hand calcium binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 609202 MGI: 2384873 HomoloGene: 5088 GeneCards: SCGN
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular region • neuron projection • гіалоплазма • transport vesicle membrane • синапс • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • дендрит (нейробіологія) • presynapse Біологічний процес • regulation of cytosolic calcium ion concentration • GO:0022610 життєдіяльність • regulation of presynaptic cytosolic calcium ion concentration • regulation of long-term synaptic potentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10590	214189
Ensembl	ENSG00000079689	ENSMUSG00000021337
UniProt	O76038	Q91WD9
RefSeq (мРНК)	NM_006998	NM_145399
RefSeq (білок)	NP_008929	NP_663374
Локус (UCSC)	Хр. 6: 25.65 – 25.7 Mb	Хр. 13: 24.14 – 24.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCGN (англ. Secretagogin, EF-hand calcium binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 276 амінокислот, а молекулярна маса — 32 040.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSSREPTLG		RLDAAGFWQV		WQRFDADEKG		YIEEKELDAF		FLHMLMKLGT
DDTVMKANLH		KVKQQFMTTQ		DASKDGRIRM		KELAGMFLSE		DENFLLLFRR
ENPLDSSVEF		MQIWRKYDAD		SSGFISAAEL		RNFLRDLFLH		HKKAISEAKL
EEYTGTMMKI		FDRNKDGRLD		LNDLARILAL		QENFLLQFKM		DACSTEERKR
DFEKIFAYYD		VSKTGALEGP		EVDGFVKDMM		ELVQPSISGV		DLDKFREILL
RHCDVNKDGK		IQKSELALCL		GLKINP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6