SCYL2

SCYL2
Ідентифікатори
Символи	SCYL2, CVAK104, SCY1 like pseudokinase 2, AMCNACC, AMC4
Зовнішні ІД	OMIM: 616365 MGI: 1289172 HomoloGene: 13349 GeneCards: SCYL2
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP binding • signaling receptor binding • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • endosome membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • цитоплазма • ендосома • perinuclear region of cytoplasm Біологічний процес • receptor internalization involved in canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein phosphorylation • endosome to lysosome transport • positive regulation of clathrin-dependent endocytosis • positive regulation of receptor internalization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55681	213326
Ensembl	ENSG00000136021	ENSMUSG00000069539
UniProt	Q6P3W7	Q8CFE4
RefSeq (мРНК)	NM_017988 NM_001317784 NM_001330253 NM_001330254 NM_001330256	NM_198021 NM_001310704 NM_001358843
RefSeq (білок)	NP_001304713 NP_001317182 NP_001317183 NP_001317185 NP_060458	NP_001297633 NP_932138 NP_001345772
Локус (UCSC)	Хр. 12: 100.27 – 100.34 Mb	Хр. 10: 89.47 – 89.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCYL2 (англ. SCY1 like pseudokinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 929 амінокислот, а молекулярна маса — 103 709.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESMLNKLKS		TVTKVTADVT		SAVMGNPVTR		EFDVGRHIAS		GGNGLAWKIF
NGTKKSTKQE		VAVFVFDKKL		IDKYQKFEKD		QIIDSLKRGV		QQLTRLRHPR
LLTVQHPLEE		SRDCLAFCTE		PVFASLANVL		GNWENLPSPI		SPDIKDYKLY
DVETKYGLLQ		VSEGLSFLHS		SVKMVHGNIT		PENIILNKSG		AWKIMGFDFC
VSSTNPSEQE		PKFPCKEWDP		NLPSLCLPNP		EYLAPEYILS		VSCETASDMY
SLGTVMYAVF		NKGKPIFEVN		KQDIYKSFSR		QLDQLSRLGS		SSLTNIPEEV
REHVKLLLNV		TPTVRPDADQ		MTKIPFFDDV		GAVTLQYFDT		LFQRDNLQKS
QFFKGLPKVL		PKLPKRVIVQ		RILPCLTSEF		VNPDMVPFVL		PNVLLIAEEC
TKEEYVKLIL		PELGPVFKQQ		EPIQILLIFL		QKMDLLLTKT		PPDEIKNSVL
PMVYRALEAP		SIQIQELCLN		IIPTFANLID		YPSMKNALIP		RIKNACLQTS
SLAVRVNSLV		CLGKILEYLD		KWFVLDDILP		FLQQIPSKEP		AVLMGILGIY
KCTFTHKKLG		ITKEQLAGKV		LPHLIPLSIE		NNLNLNQFNS		FISVIKEMLN
RLESEHKTKL		EQLHIMQEQQ		KSLDIGNQMN		VSEEMKVTNI		GNQQIDKVFN
NIGADLLTGS		ESENKEDGLQ		NKHKRASLTL		EEKQKLAKEQ		EQAQKLKSQQ
PLKPQVHTPV		ATVKQTKDLT		DTLMDNMSSL		TSLSVSTPKS		SASSTFTSVP
SMGIGMMFST		PTDNTKRNLT		NGLNANMGFQ		TSGFNMPVNT		NQNFYSSPST
VGVTKMTLGT		PPTLPNFNAL		SVPPAGAKQT		QQRPTDMSAL		NNLFGPQKPK
VSMNQLSQQK		PNQWLNQFVP		PQGSPTMGSS		VMGTQMNVIG		QSAFGMQGNP
FFNPQNFAQP		PTTMTNSSSA		SNDLKDLFG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Conner S.D., Schmid S.L. (2005). CVAK104 is a novel poly-L-lysine-stimulated kinase that targets the beta2-subunit of AP2. J. Biol. Chem. 280: 21539—21544. PMID 15809293 DOI:10.1074/jbc.M502462200
• Duewel M., Ungewickell E.J. (2006). Clathrin-dependent association of CVAK104 with endosomes and the trans-Golgi network. Mol. Biol. Cell. 17: 4513—4525. PMID 16914521 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0390

Див. також

• Хромосома 12