SDC2

SDC2
Ідентифікатори
Символи	SDC2, CD362, HSPG, HSPG1, SYND2, syndecan 2
Зовнішні ІД	OMIM: 142460 MGI: 1349165 HomoloGene: 2253 GeneCards: SDC2
Онтологія гена Молекулярна функція • PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal lumen • Golgi lumen • endoplasmic reticulum lumen • cell surface • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • glycosaminoglycan metabolic process • диференціація клітин • ephrin receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • retinoid metabolic process • regulation of dendrite morphogenesis • біолюмінесценція • glycosaminoglycan catabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • leukocyte migration • посттрансляційна модифікація • cell migration • dendrite morphogenesis • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6383	15529
Ensembl	ENSG00000169439	ENSMUSG00000022261
UniProt	P34741	P43407
RefSeq (мРНК)	NM_002998	NM_008304
RefSeq (білок)	NP_002989	NP_032330
Локус (UCSC)	Хр. 8: 96.49 – 96.61 Mb	Хр. 15: 32.92 – 33.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SDC2 (англ. Syndecan 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 160.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRAWILLTL		GLVACVSAES		RAELTSDKDM		YLDNSSIEEA		SGVYPIDDDD
YASASGSGAD		EDVESPELTT		SRPLPKILLT		SAAPKVETTT		LNIQNKIPAQ
TKSPEETDKE		KVHLSDSERK		MDPAEEDTNV		YTEKHSDSLF		KRTEVLAAVI
AGGVIGFLFA		IFLILLLVYR		MRKKDEGSYD		LGERKPSSAA		YQKAPTKEFY
A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до світлочутливих білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як люмінесценція, диференціація клітин, нейрогенез. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
• Marynen P., Zhang J., Cassiman J.-J., den Berghe H., David G. (1989). Partial primary structure of the 48- and 90-kilodalton core proteins of cell surface-associated heparan sulfate proteoglycans of lung fibroblasts. Prediction of an integral membrane domain and evidence for multiple distinct core proteins at the cell surface of human lung fibroblasts. J. Biol. Chem. 264: 7017—7024. PMID 2523388

Див. також

• Хромосома 8