SDK2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
SDK2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SDK2, sidekick cell adhesion molecule 2
Зовнішні ІД OMIM: 607217 MGI: 2443847 HomoloGene: 10406 GeneCards: SDK2
Пов'язані генетичні захворювання
панічний розлад[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001144952
NM_019064
NM_172800
RefSeq (білок)
NP_001138424
NP_766388
Локус (UCSC) Хр. 17: 73.33 – 73.64 Mb Хр. 11: 113.67 – 113.96 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SDK2 (англ. Sidekick cell adhesion molecule 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 172 амінокислот, а молекулярна маса — 239 396[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MWGLLIWTLLALHQIRAARAQDDVSPYFKTEPVRTQVHLEGNRLVLTCMA
EGSWPLEFKWLHNNRELTKFSLEYRYMITSLDRTHAGFYRCIVRNRMGAL
LQRQTEVQVAYMGSFEEGEKHQSVSHGEAAVIRAPRIASFPQPQVTWFRD
GRKIPPSSRIAITLENTLVILSTVAPDAGRYYVQAVNDKNGDNKTSQPIT
LTVENVGGPADPIAPTIIIPPKNTSVVAGTSEVTLECVANARPLIKLHII
WKKDGVLLSGGISDHNRRLTIPNPTGSDAGYYECEAVLRSSSVPSVVRGA
YLSVLEPPQFVKEPERHITAEMEKVVDIPCQAKGVPPPSITWYKDAAVVE
VEKLTRFRQRNDGGLQISGLVPDDTGMFQCFARNAAGEVQTSTYLAVTSI
APNITRGPLDSTVIDGMSVVLACETSGAPRPAITWQKGERILASGSVQLP
RFTPLESGSLLISPTHISDAGTYTCLATNSRGVDEASADLVVWARTRITK
PPQDQSVIKGTQASMVCGVTHDPRVTIRYIWEKDGATLGTESHPRIRLDR
NGSLHISQTWSGDIGTYTCRVISAGGNDSRSAHLRVRQLPHAPEHPVATL
STVERRAINLTWTKPFDGNSPLIRYILEMSENNAPWTVLLASVDPKATSV
TVKGLVPARSYQFRLCAVNDVGKGQFSKDTERVSLPEEPPTAPPQNVIAS
GRTNQSIMIQWQPPPESHQNGILKGYIIRYCLAGLPVGYQFKNITDADVN
NLLLEDLIIWTNYEIEVAAYNSAGLGVYSSKVTEWTLQGVPTVPPGNVHA
EATNSTTIRFTWNAPSPQFINGINQGYKLIAWEPEQEEEVTMVTARPNFQ
DSIHVGFVSGLKKFTEYFTSVLCFTTPGDGPRSTPQLVRTHEDVPGPVGH
LSFSEILDTSLKVSWQEPGEKNGILTGYRISWEEYNRTNTRVTHYLPNVT
LEYRVTGLTALTTYTIEVAAMTSKGQGQVSASTISSGVPPELPGPPTNLG
ISNIGPRSVTLQFRPGYDGKTSISRWLVEAQVGVVGEGEEWLLIHQLSNE
PDARSMEVPDLNPFTCYSFRMRQVNIVGTSPPSQPSRKIQTLQAPPDMAP
ANVSLRTASETSLWLRWMPLPEMEYNGNPESVGYKIKYSRSDGHGKTLSH
VVQDRVERDYTIEDLEEWTEYRVQVQAFNAIGSGPWSQTVVGRTRESVPS
SGPTNVSALATTSSSMLVRWSEVPEADRNGLVLGYKVMYKEKDSDTQPRF
WLVEGNSSRSAQLTGLGKYVLYEVQVLAFTRIGDGSPSHPPILERTLDDV
PGPPMGILFPEVRTTSVRLIWQPPAAPNGIILAYQITHRLNTTTANTATV
EVLAPSARQYTATGLKPESVYLFRITAQTRKGWGEAAEALVVTTEKRDRP
QPPSRPMVQQEDVRARSVLLSWEPGSDGLSPVRYYTIQTRELPSGRWALH
SASVSHNASSFIVDRLKPFTSYKFRVKATNDIGDSEFSEESESLTTLQAA
PDEAPTILSVTPHTTTSVLIRWQPPAEDKINGILLGFRIRYRELLYEGLR
GFTLRGINNPGATWAELTSMYSMRNLSRPSLTQYELDNLNKHRRYEIRMS
VYNAVGEGPSSPPQEVFVGEAVPTAAPRNVVVHGATATQLDVTWEPPPLD
SQNGDIQGYKIYFWEAQRGNLTERVKTLFLAENSVKLKNLTGYTAYMVSV
AAFNAAGDGPRSTPTQGQTQQAAPSAPSSVKFSELTTTSVNVSWEAPQFP
NGILEGYRLVYEPCSPVDGVSKIVTVDVKGNSPLWLKVKDLAEGVTYRFR
IRAKTFTYGPEIEANVTTGPGEGAPGPPGVPIIVRYSSAIAIHWSSGDPG
KGPITRYVIEARPSDEGLWDILIKDIPKEVSSYTFSMDILKPGVSYDFRV
IAVNDYGFGTPSSPSQSVPAQKANPFYEEWWFLVVIALVGLIFILLLVFV
LIIRGQSKKYAKKTDSGNSAKSGALGHSEMMSLDESSFPALELNNRRLSV
KNSFCRKNGLYTRSPPRPSPGSLHYSDEDVTKYNDLIPAESSSLTEKPSE
ISDSQGSDSEYEVDSNHQKAHSFVNHYISDPTYYNSWRRQQKGISRAQAY
SYTESDSGEPDHTTVTNSTSTQQGSLFRPKASRTPTPQNPPNPPSQQSTL
YRPPSSLAPGSRAPIAGFSSFV

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]