SEC24C

SEC24C
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EH2
Ідентифікатори
Символи	SEC24C, SEC24 homolog C, COPII coat complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 607185 MGI: 1919746 HomoloGene: 3615 GeneCards: SEC24C
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • COPII vesicle coat • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • in utero embryonic development • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9632	218811
Ensembl	ENSG00000176986	ENSMUSG00000039367
UniProt	P53992	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_004922 NM_198597	NM_001168273 NM_172596
RefSeq (білок)	NP_004913 NP_940999	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 10: 73.74 – 73.77 Mb	Хр. 14: 20.72 – 20.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEC24C (англ. SEC24 homolog C, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 094 амінокислот, а молекулярна маса — 118 325.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNVNQSVPPV		PPFGQPQPIY		PGYHQSSYGG		QSGSTAPAIP		YGAYNGPVPG
YQQTPPQGMS		RAPPSSGAPP		ASTAQAPCGQ		AAYGQFGQGD		VQNGPSSTVQ
MQRLPGSQPF		GSPLAPVGNQ		PPVLQPYGPP		PTSAQVATQL		SGMQISGAVA
PAPPSSGLGF		GPPTSLASAS		GSFPNSGLYG		SYPQGQAPPL		SQAQGHPGIQ
TPQRSAPSQA		SSFTPPASGG		PRLPSMTGPL		LPGQSFGGPS		VSQPNHVSSP
PQALPPGTQM		TGPLGPLPPM		HSPQQPGYQP		QQNGSFGPAR		GPQSNYGGPY
PAAPTFGSQP		GPPQPLPPKR		LDPDAIPSPI		QVIEDDRNNR		GTEPFVTGVR
GQVPPLVTTN		FLVKDQGNAS		PRYIRCTSYN		IPCTSDMAKQ		AQVPLAAVIK
PLARLPPEEA		SPYVVDHGES		GPLRCNRCKA		YMCPFMQFIE		GGRRFQCCFC
SCINDVPPQY		FQHLDHTGKR		VDAYDRPELS		LGSYEFLATV		DYCKNNKFPS
PPAFIFMIDV		SYNAIRTGLV		RLLCEELKSL		LDFLPREGGA		EESAIRVGFV
TYNKVLHFYN		VKSSLAQPQM		MVVSDVADMF		VPLLDGFLVN		VNESRAVITS
LLDQIPEMFA		DTRETETVFV		PVIQAGMEAL		KAAECAGKLF		LFHTSLPIAE
APGKLKNRDD		RKLINTDKEK		TLFQPQTGAY		QTLAKECVAQ		GCCVDLFLFP
NQYVDVATLS		VVPQLTGGSV		YKYASFQVEN		DQERFLSDLR		RDVQKVVGFD
AVMRVRTSTG		IRAVDFFGAF		YMSNTTDVEL		AGLDGDKTVT		VEFKHDDRLN
EESGALLQCA		LLYTSCAGQR		RLRIHNLALN		CCTQLADLYR		NCETDTLINY
MAKFAYRGVL		NSPVKAVRDT		LITQCAQILA		CYRKNCASPS		SAGQLILPEC
MKLLPVYLNC		VLKSDVLQPG		AEVTTDDRAY		VRQLVTSMDV		TETNVFFYPR
LLPLTKSPVE		STTEPPAVRA		SEERLSNGDI		YLLENGLNLF		LWVGASVQQG
VVQSLFSVSS		FSQITSGLSV		LPVLDNPLSK		KVRGLIDSLR		AQRSRYMKLT
VVKQEDKMEM		LFKHFLVEDK		SLSGGASYVD		FLCHMHKEIR		QLLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tani K., Oyama Y., Hatsuzawa K., Tagaya M. (1999). Hypothetical protein KIAA0079 is a mammalian homologue of yeast Sec24p. FEBS Lett. 447: 247—250. PMID 10214955 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00303-8
• Tang B.L., Kausalya J., Low D.Y.H., Lock M.L., Hong W. (1999). A family of mammalian proteins homologous to yeast Sec24p. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258: 679—684. PMID 10329445 DOI:10.1006/bbrc.1999.0574
• Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
• Bonnon C., Wendeler M.W., Paccaud J.P., Hauri H.P. (2010). Selective export of human GPI-anchored proteins from the endoplasmic reticulum. J. Cell Sci. 123: 1705—1715. PMID 20427317 DOI:10.1242/jcs.062950
• Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208

Див. також

• Хромосома 10