SECISBP2

SECISBP2
Ідентифікатори
Символи	SECISBP2, SBP2, SECIS binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607693 MGI: 1922670 HomoloGene: 11415 GeneCards: SECISBP2
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA 3'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • selenocysteine insertion sequence binding • ribonucleoprotein complex binding Клітинна компонента • клітинне ядро • мітохондрія • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • Біосинтез білків • striatum development • neuron development • negative regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • selenocysteine incorporation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79048	75420
Ensembl	ENSG00000187742	ENSMUSG00000035139
UniProt	Q96T21	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001282688 NM_001282689 NM_001282690 NM_024077 NM_001354696 NM_001354697 NM_001354698 NM_001354702	NM_029279 NM_001308448
RefSeq (білок)	NP_001269617 NP_001269618 NP_001269619 NP_076982 NP_001341625 NP_001341626 NP_001341627 NP_001341631	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 9: 89.32 – 89.36 Mb	Хр. 13: 51.81 – 51.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SECISBP2 (англ. SECIS binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 854 амінокислот, а молекулярна маса — 95 462.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASEGPREPE		SEGIKLSADV		KPFVPRFAGL		NVAWLESSEA		CVFPSSAATY
YPFVQEPPVT		EQKIYTEDMA		FGASTFPPQY		LSSEITLHPY		AYSPYTLDST
QNVYSVPGSQ		YLYNQPSCYR		GFQTVKHRNE		NTCPLPQEMK		ALFKKKTYDE
KKTYDQQKFD		SERADGTISS		EIKSARGSHH		LSIYAENSLK		SDGYHKRTDR
KSRIIAKNVS		TSKPEFEFTT		LDFPELQGAE		NNMSEIQKQP		KWGPVHSVST
DISLLREVVK		PAAVLSKGEI		VVKNNPNESV		TANAATNSPS		CTRELSWTPM
GYVVRQTLST		ELSAAPKNVT		SMINLKTIAS		SADPKNVSIP		SSEALSSDPS
YNKEKHIIHP		TQKSKASQGS		DLEQNEASRK		NKKKKEKSTS		KYEVLTVQEP
PRIEDAEEFP		NLAVASERRD		RIETPKFQSK		QQPQDNFKNN		VKKSQLPVQL
DLGGMLTALE		KKQHSQHAKQ		SSKPVVVSVG		AVPVLSKECA		SGERGRRMSQ
MKTPHNPLDS		SAPLMKKGKQ		REIPKAKKPT		SLKKIILKER		QERKQRLQEN
AVSPAFTSDD		TQDGESGGDD		QFPEQAELSG		PEGMDELIST		PSVEDKSEEP
PGTELQRDTE		ASHLAPNHTT		FPKIHSRRFR		DYCSQMLSKE		VDACVTDLLK
ELVRFQDRMY		QKDPVKAKTK		RRLVLGLREV		LKHLKLKKLK		CVIISPNCEK
IQSKGGLDDT		LHTIIDYACE		QNIPFVFALN		RKALGRSLNK		AVPVSVVGIF
SYDGAQDQFH		KMVELTVAAR		QAYKTMLENV		QQELVGEPRP		QAPPSLPTQG
PSCPAEDGPP		ALKEKEEPHY		IEIWKKHLEA		YSGCTLELEE		SLEASTSQMM
NLNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білка, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

• Lescure A., Allmang C., Yamada K., Carbon P., Krol A. (2002). cDNA cloning, expression pattern and RNA binding analysis of human selenocysteine insertion sequence (SECIS) binding protein 2. Gene. 291: 279—285. PMID 12095701 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00629-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9