SEMA4B

SEMA4B
Ідентифікатори
Символи	SEMA4B, SEMAC, SemC, semaphorin 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 617029 MGI: 107559 HomoloGene: 8426 GeneCards: SEMA4B
Онтологія гена Молекулярна функція • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • міжклітинний простір • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10509	20352
Ensembl	ENSG00000185033	ENSMUSG00000030539
UniProt	Q9NPR2	Q62179
RefSeq (мРНК)	NM_020210 NM_198925 NM_001324029 NM_001324030 NM_001324031 NM_001324032 NM_001324034 NM_001393916	NM_013659 NM_001360135
RefSeq (білок)	NP_001310958 NP_001310959 NP_001310960 NP_001310961 NP_001310962 NP_001310963 NP_064595 NP_945119	NP_038687 NP_001347064
Локус (UCSC)	Хр. 15: 90.16 – 90.23 Mb	Хр. 7: 79.84 – 79.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEMA4B (англ. Semaphorin 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 832 амінокислот, а молекулярна маса — 92 193.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLRSWLAAP		WGALPPRPPL		LLLLLLLLLL		QPPPPTWALS		PRISLPLGSE
ERPFLRFEAE		HISNYTALLL		SRDGRTLYVG		AREALFALSS		NLSFLPGGEY
QELLWGADAE		KKQQCSFKGK		DPQRDCQNYI		KILLPLSGSH		LFTCGTAAFS
PMCTYINMEN		FTLARDEKGN		VLLEDGKGRC		PFDPNFKSTA		LVVDGELYTG
TVSSFQGNDP		AISRSQSLRP		TKTESSLNWL		QDPAFVASAY		IPESLGSLQG
DDDKIYFFFS		ETGQEFEFFE		NTIVSRIARI		CKGDEGGERV		LQQRWTSFLK
AQLLCSRPDD		GFPFNVLQDV		FTLSPSPQDW		RDTLFYGVFT		SQWHRGTTEG
SAVCVFTMKD		VQRVFSGLYK		EVNRETQQWY		TVTHPVPTPR		PGACITNSAR
ERKINSSLQL		PDRVLNFLKD		HFLMDGQVRS		RMLLLQPQAR		YQRVAVHRVP
GLHHTYDVLF		LGTGDGRLHK		AVSVGPRVHI		IEELQIFSSG		QPVQNLLLDT
HRGLLYAASH		SGVVQVPMAN		CSLYRSCGDC		LLARDPYCAW		SGSSCKHVSL
YQPQLATRPW		IQDIEGASAK		DLCSASSVVS		PSFVPTGEKP		CEQVQFQPNT
VNTLACPLLS		NLATRLWLRN		GAPVNASASC		HVLPTGDLLL		VGTQQLGEFQ
CWSLEEGFQQ		LVASYCPEVV		EDGVADQTDE		GGSVPVIIST		SRVSAPAGGK
ASWGADRSYW		KEFLVMCTLF		VLAVLLPVLF		LLYRHRNSMK		VFLKQGECAS
VHPKTCPVVL		PPETRPLNGL		GPPSTPLDHR		GYQSLSDSPP		GSRVFTESEK
RPLSIQDSFV		EVSPVCPRPR		VRLGSEIRDS		VV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15