SENP2

SENP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TGZ, 1TH0, 2IO0, 2IO1, 2IO2, 2IO3, 3ZO5, 5AEK
Ідентифікатори
Символи	SENP2, AXAM2, SMT3IP2, SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 2, SUMO specific peptidase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608261 MGI: 1923076 HomoloGene: 11005 GeneCards: SENP2
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • SUMO-specific endopeptidase activity • protein domain specific binding Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна мембрана • мембрана • Ядерна пора • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерні тільця • PML body • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • mRNA transport • Wnt signaling pathway • protein sumoylation • протеоліз • negative regulation of protein ubiquitination • regulation of Wnt signaling pathway • protein destabilization • protein transport • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of protein phosphorylation • heart development • dorsal/ventral axis specification • protein desumoylation • negative regulation of protein binding • regulation of DNA endoreduplication • negative regulation of chromatin binding • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of protein metabolic process • trophoblast giant cell differentiation • labyrinthine layer development • spongiotrophoblast layer development • negative regulation of signal transduction by p53 class mediator • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	59343	75826
Ensembl	ENSG00000163904	ENSMUSG00000022855
UniProt	Q9HC62	Q91ZX6
RefSeq (мРНК)	NM_021627	NM_029457 NM_001357424
RefSeq (білок)	NP_067640	NP_083733 NP_001344353
Локус (UCSC)	Хр. 3: 185.58 – 185.63 Mb	Хр. 16: 21.83 – 21.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SENP2 (англ. SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 67 855.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYRWLVRILG		TIFRFCDRSV		PPARALLKRR		RSDSTLFSTV		DTDEIPAKRP
RLDCFIHQVK		NSLYNAASLF		GFPFQLTTKP		MVTSACNGTR		NVAPSGEVFS
NSSSCELTGS		GSWNNMLKLG		NKSPNGISDY		PKIRVTVTRD		QPRRVLPSFG
FTLNSEGCNR		RPGGRRHSKG		NPESSLMWKP		QEQAVTEMIS		EESGKGLRRP
HCTVEEGVQK		EEREKYRKLL		ERLKESGHGN		SVCPVTSNYH		SSQRSQMDTL
KTKGWGEEQN		HGVKTTQFVP		KQYRLVETRG		PLCSLRSEKR		CSKGKITDTE
TMVGIRFENE		SRRGYQLEPD		LSEEVSARLR		LGSGSNGLLR		RKVSIIETKE
KNCSGKERDR		RTDDLLELTE		DMEKEISNAL		GHGPQDEILS		SAFKLRITRG
DIQTLKNYHW		LNDEVINFYM		NLLVERNKKQ		GYPALHVFST		FFYPKLKSGG
YQAVKRWTKG		VNLFEQEIIL		VPIHRKVHWS		LVVIDLRKKC		LKYLDSMGQK
GHRICEILLQ		YLQDESKTKR		NSDLNLLEWT		HHSMKPHEIP		QQLNGSDCGM
FTCKYADYIS		RDKPITFTQH		QMPLFRKKMV		WEILHQQLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, транспорт мРНК, транслокація, сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang H., Saitoh H., Matunis M.J. (2002). Enzymes of the SUMO modification pathway localize to filaments of the nuclear pore complex. Mol. Cell. Biol. 22: 6498—6508. PMID 12192048 DOI:10.1128/MCB.22.18.6498-6508.2002
• Hang J., Dasso M. (2002). Association of the human SUMO-1 protease SENP2 with the nuclear pore. J. Biol. Chem. 277: 19961—19966. PMID 11896061 DOI:10.1074/jbc.M201799200
• Itahana Y., Yeh E.T.H., Zhang Y. (2006). Nucleocytoplasmic shuttling modulates activity and ubiquitination-dependent turnover of SUMO-specific protease 2. Mol. Cell. Biol. 26: 4675—4689. PMID 16738331 DOI:10.1128/MCB.01830-05
• Cong L., Pakala S.B., Ohshiro K., Li D.Q., Kumar R. (2011). SUMOylation and SUMO-interacting motif (SIM) of metastasis tumor antigen 1 (MTA1) synergistically regulate its transcriptional repressor function. J. Biol. Chem. 286: 43793—43808. PMID 21965678 DOI:10.1074/jbc.M111.267237

Див. також

• Хромосома 3