SFTPD

SFTPD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1B08, 1M7L, 1PW9, 1PWB, 2GGU, 2GGX, 2ORJ, 2ORK, 2OS9, 2RIA, 2RIB, 2RIC, 2RID, 2RIE, 3DBZ, 3G81, 3G83, 3G84, 3IKN, 3IKP, 3IKQ, 3IKR, 4E52, 4M17, 4M18
Ідентифікатори
Символи	SFTPD, COLEC7, PSP-D, SFTP4, SP-D, surfactant protein D
Зовнішні ІД	OMIM: 178635 MGI: 109515 HomoloGene: 2272 GeneCards: SFTPD
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, хронічне обструктивне захворювання легень
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • identical protein binding • lipopolysaccharide binding • monosaccharide binding Клітинна компонента • цитоплазма • колаген • endoplasmic reticulum membrane • clathrin-coated endocytic vesicle • endocytic vesicle • extracellular region • лізосома • міжклітинний простір • multivesicular body • rough endoplasmic reticulum Біологічний процес • surfactant homeostasis • positive regulation of phagocytosis • процес імунної системи • рецептор-опосередкований ендоцитоз • respiratory gaseous exchange by respiratory system • reactive oxygen species metabolic process • GO:0032657 regulation of cytokine production • negative regulation of T cell proliferation • macrophage chemotaxis • defense response to bacterium • regulation of immune response • lung alveolus development • вроджений імунітет • toll-like receptor signaling pathway • induction of bacterial agglutination • regulation of adhesion of symbiont to host epithelial cell • GO:0007571 розвойовий процес Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6441	20390
Ensembl	ENSG00000133661	ENSMUSG00000021795
UniProt	P35247	P50404
RefSeq (мРНК)	NM_003019	NM_009160
RefSeq (білок)	NP_003010	NP_033186
Локус (UCSC)	Хр. 10: 79.94 – 79.98 Mb	Хр. 14: 40.89 – 40.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SFTPD (англ. Surfactant protein D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 375 амінокислот, а молекулярна маса — 37 728.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLFLLSALV		LLTQPLGYLE		AEMKTYSHRT		MPSACTLVMC		SSVESGLPGR
DGRDGREGPR		GEKGDPGLPG		AAGQAGMPGQ		AGPVGPKGDN		GSVGEPGPKG
DTGPSGPPGP		PGVPGPAGRE		GPLGKQGNIG		PQGKPGPKGE		AGPKGEVGAP
GMQGSAGARG		LAGPKGERGV		PGERGVPGNT		GAAGSAGAMG		PQGSPGARGP
PGLKGDKGIP		GDKGAKGESG		LPDVASLRQQ		VEALQGQVQH		LQAAFSQYKK
VELFPNGQSV		GEKIFKTAGF		VKPFTEAQLL		CTQAGGQLAS		PRSAAENAAL
QQLVVAKNEA		AFLSMTDSKT		EGKFTYPTGE		SLVYSNWAPG		EPNDDGGSED
CVEIFTNGKW		NDRACGEKRL		VVCEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Lu J., Willis A.C., Reid K.B.M. (1992). Purification, characterization and cDNA cloning of human lung surfactant protein D. Biochem. J. 284: 795—802. PMID 1339284 DOI:10.1042/bj2840795
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hakansson K., Lim N.K., Hoppe H.-J., Reid K.B.M. (1999). Crystal structure of the trimeric alpha-helical coiled-coil and the three lectin domains of human lung surfactant protein D. Structure. 7: 255—264. PMID 10368295 DOI:10.1016/S0969-2126(99)80036-7
• Crouch E., Rust K., Veile R., Donis-Keller H., Grosso L. (1993). Genomic organization of human surfactant protein D (SP-D). SP-D is encoded on chromosome 10q22.2-23.1. J. Biol. Chem. 268: 2976—2983. PMID 8428971
• Crouch E., Persson A., Chang D. (1993). Accumulation of surfactant protein D in human pulmonary alveolar proteinosis. Am. J. Pathol. 142: 241—248. PMID 8424457

Див. також

• Хромосома 10