SGSM1

SGSM1
Ідентифікатори
Символи	SGSM1, RUTBC2, small G protein signaling modulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611417 MGI: 107320 HomoloGene: 64485 GeneCards: SGSM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • мембрана • цитоплазма • cytoplasmic vesicle membrane • гіалоплазма • система ендомембран • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • intracellular protein transport • regulation of vesicle fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	129049	52850
Ensembl	ENSG00000167037	ENSMUSG00000042216
UniProt	Q2NKQ1	Q8BPQ7
RefSeq (мРНК)	NM_133454 NM_001039948 NM_001098497 NM_001098498	NM_001162965 NM_001254731 NM_172718 NM_001309526 NM_001309528
RefSeq (білок)	NP_001035037 NP_001091967 NP_001091968 NP_597711	NP_001156437 NP_001241660 NP_001296455 NP_001296457 NP_766306
Локус (UCSC)	Хр. 22: 24.81 – 24.93 Mb	Хр. 5: 113.39 – 113.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SGSM1 (англ. Small G protein signaling modulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 148 амінокислот, а молекулярна маса — 129 718.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASAPAEAET		RQRLLRTVKK		EVKQIMEEAV		TRKFVHEDSS		HIISFCAAVE
ACVLHGLRRR		AAGFLRSNKI		AALFMKVGKN		FPPAEDLSRK		VQDLEQLIES
ARNQIQGLQE		NVRKLPKLPN		LSPLAIKHLW		IRTALFEKVL		DKIVHYLVEN
SSKYYEKEAL		LMDPVDGPIL		ASLLVGPCAL		EYTKMKTADH		FWTDPSADEL
VQRHRIHSSH		VRQDSPTKRP		ALCIQKRHSS		GSMDDRPSLS		ARDYVESLHQ
NSRATLLYGK		NNVLVQPRDD		MEAVPGYLSL		HQTADVMTLK		WTPNQLMNGS
VGDLDYEKSV		YWDYAMTIRL		EEIVYLHCHQ		QVDSGGTVVL		VSQDGIQRPP
FRFPKGGHLL		QFLSCLENGL		LPHGQLDPPL		WSQRGKGKVF		PKLRKRSPQG
SAESTSSDKD		DDEATDYVFR		IIYPGMQSEF		VAPDFLGSTS		SVSVGPAWMM
VPAGRSMLVV		ARGSQWEPAR		WDTTLPTPSP		KEQPPMPQDL		MDVSVSNLPS
LWQPSPRKSS		CSSCSQSGSA		DGSSTNGCNH		ERAPLKLLCD		NMKYQILSRA
FYGWLAYCRH		LSTVRTHLSA		LVNHMIVSPD		LPCDAGQGLT		ARIWEQYLHD
STSYEEQELL		RLIYYGGIQP		EIRKAVWPFL		LGHYQFGMTE		TERKEVDEQI
HACYAQTMAE		WLGCEAIVRQ		RERESHAAAL		AKCSSGASLD		SHLHRMLHRD
STISNESSQS		CSSGRQNIRL		HSDSSSSTQV		FESVDEVEQV		EAEGRLEEKQ
PKIPNGNLVN		GTCSPDSGHP		SSHNFSSGLS		EHSEPSLSTE		DSVLDAQRNT
PTVLRPRDGS		VDDRQSSEAT		TSQDEAPREE		LAVQDSLESD		LLANESMDEF
MSITGSLDMA		LPEKDDVVME		GWRSSETEKH		GQADSEDNLS		EEPEMESLFP
ALASLAVTTS		ANEVSPVSSS		GVTYSPELLD		LYTVNLHRIE		KDVQRCDRNY
WYFTPANLEK		LRNIMCSYIW		QHIEIGYVQG		MCDLLAPLLV		ILDDEALAFS
CFTELMKRMN		QNFPHGGAMD		THFANMRSLI		QILDSELFEL		MHQNGDYTHF
YFCYRWFLLD		FKRELVYDDV		FLVWETIWAA		KHVSSAHYVL		FIALALVEVY
RDIILENNMD		FTDIIKFFNE		MAERHNTKQV		LKLARDLVYK		VQTLIENK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
• Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22