SHROOM2

SHROOM2
Ідентифікатори
Символи	SHROOM2, APXL, HSAPXL, shroom family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300103 MGI: 107194 HomoloGene: 84697 GeneCards: SHROOM2
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-catenin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ligand-gated sodium channel activity • actin binding • actin filament binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • bicellular tight junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • apical plasma membrane • cortical actin cytoskeleton • мікротрубочка • цитоскелет • екзосома • Адгезивні контакти • apical junction complex Біологічний процес • eye pigment granule organization • ear development • actin filament bundle assembly • multicellular organism development • melanosome organization • brain development • lens morphogenesis in camera-type eye • GO:0000767 cell morphogenesis • camera-type eye development • cellular pigment accumulation • cell migration • camera-type eye morphogenesis • sodium ion transmembrane transport • establishment of melanosome localization • apical protein localization • actin filament organization • actin cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	357	110380
Ensembl	ENSG00000146950	ENSMUSG00000045180
UniProt	Q13796	A2ALU4
RefSeq (мРНК)	NM_001649 NM_001320663 NM_001320664	NM_001290684 NM_001290685 NM_001290686 NM_001290687 NM_172441 NM_001359158 NM_001359161 NM_001359163
RefSeq (білок)	NP_001307592 NP_001307593 NP_001640	NP_001277613 NP_001277614 NP_001277615 NP_001277616 NP_766029 NP_001346087 NP_001346090 NP_001346092
Локус (UCSC)	Хр. X: 9.79 – 9.95 Mb	Хр. X: 151.39 – 151.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SHROOM2 (англ. Shroom family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 616 амінокислот, а молекулярна маса — 176 410.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGAEPRARP		ERLAEAETRA		ADGGRLVEVQ		LSGGAPWGFT		LKGGREHGEP
LVITKIEEGS		KAAAVDKLLA		GDEIVGINDI		GLSGFRQEAI		CLVKGSHKTL
KLVVKRRSEL		GWRPHSWHAT		KFSDSHPELA		ASPFTSTSGC		PSWSGRHHAS
SSSHDLSSSW		EQTNLQRTLD		HFSSLGSVDS		LDHPSSRLSV		AKSNSSIDHL
GSHSKRDSAY		GSFSTSSSTP		DHTLSKADTS		SAENILYTVG		LWEAPRQGGR
QAQAAGDPQG		SEEKLSCFPP		RVPGDSGKGP		RPEYNAEPKL		AAPGRSNFGP
VWYVPDKKKA		PSSPPPPPPP		LRSDSFAATK		SHEKAQGPVF		SEAAAAQHFT
ALAQAQPRGD		RRPELTDRPW		RSAHPGSLGK		GSGGPGCPQE		AHADGSWPPS
KDGASSRLQA		SLSSSDVRFP		QSPHSGRHPP		LYSDHSPLCA		DSLGQEPGAA
SFQNDSPPQV		RGLSSCDQKL		GSGWQGPRPC		VQGDLQAAQL		WAGCWPSDTA
LGALESLPPP		TVGQSPRHHL		PQPEGPPDAR		ETGRCYPLDK		GAEGCSAGAQ
EPPRASRAEK		ASQRLAASIT		WADGESSRIC		PQETPLLHSL		TQEGKRRPES
SPEDSATRPP		PFDAHVGKPT		RRSDRFATTL		RNEIQMHRAK		LQKSRSTVAL
TAAGEAEDGT		GRWRAGLGGG		TQEGPLAGTY		KDHLKEAQAR		VLRATSFKRR
DLDPNPGDLY		PESLEHRMGD		PDTVPHFWEA		GLAQPPSSTS		GGPHPPRIGG
RRRFTAEQKL		KSYSEPEKMN		EVGLTRGYSP		HQHPRTSEDT		VGTFADRWKF
FEETSKPVPQ		RPAQKQALHG		IPRDKPERPR		TAGRTCEGTE		PWSRTTSLGD
SLNAHSAAEK		AGTSDLPRRL		GTFAEYQASW		KEQRKPLEAR		SSGRCHSADD
ILDVSLDPQE		RPQHVHGRSR		SSPSTDHYKQ		EASVELRRQA		GDPGEPREEL
PSAVRAEEGQ		STPRQADAQC		REGSPGSQQH		PPSQKAPNPP		TFSELSHCRG
APELPREGRG		RAGTLPRDYR		YSEESTPADL		GPRAQSPGSP		LHARGQDSWP
VSSALLSKRP		APQRPPPPKR		EPRRYRATDG		APADAPVGVL		GRPFPTPSPA
SLDVYVARLS		LSHSPSVFSS		AQPQDTPKAT		VCERGSQHVS		GDASRPLPEA
LLPPKQQHLR		LQTATMETSR		SPSPQFAPQK		LTDKPPLLIQ		DEDSTRIERV
MDNNTTVKMV		PIKIVHSESQ		PEKESRQSLA		CPAEPPALPH		GLEKDQIKTL
STSEQFYSRF		CLYTRQGAEP		EAPHRAQPAE		PQPLGTQVPP		EKDRCTSPPG
LSYMKAKEKT		VEDLKSEELA		REIVGKDKSL		ADILDPSVKI		KTTMDLMEGI
FPKDEHLLEE		AQQRRKLLPK		IPSPRSTEER		KEEPSVPAAV		SLATNSTYYS
TSAPKAELLI		KMKDLQEQQE		HEEDSGSDLD		HDLSVKKQEL		IESISRKLQV
LREARESLLE		DVQANTVLGA		EVEAIVKGVC		KPSEFDKFRM		FIGDLDKVVN
LLLSLSGRLA		RVENALNNLD		DGASPGDRQS		LLEKQRVLIQ		QHEDAKELKE
NLDRRERIVF		DILANYLSEE		SLADYEHFVK		MKSALIIEQR		ELEDKIHLGE
EQLKCLLDSL		QPERGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X