SHROOM4

SHROOM4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EDP
Ідентифікатори
Символи	SHROOM4, SHAP, shroom family member 4, shrm4, MRXSSDS
Зовнішні ІД	OMIM: 300579 MGI: 2685570 HomoloGene: 26615 GeneCards: SHROOM4
Онтологія гена Молекулярна функція • actin filament binding • actin binding • myosin II binding Клітинна компонента • цитоплазма • myosin II complex • cortical actin cytoskeleton • filamentous actin • cytoplasmic side of plasma membrane • basal plasma membrane • apical plasma membrane • цитоскелет • stress fiber • actin cytoskeleton • мікрофіламент • Адгезивні контакти • apical junction complex Біологічний процес • multicellular organism development • brain development • когнітивність • actin cytoskeleton organization • GO:0000767 cell morphogenesis • actin filament organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57477	208431
Ensembl	ENSG00000158352	ENSMUSG00000068270
UniProt	Q9ULL8	Q1W617
RefSeq (мРНК)	NM_020717	NM_001040459 NM_001313764 NM_001313765
RefSeq (білок)	NP_065768	NP_001035549 NP_001300693 NP_001300694
Локус (UCSC)	Хр. X: 50.59 – 50.81 Mb	Хр. X: 6.31 – 6.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SHROOM4 (англ. Shroom family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 493 амінокислот, а молекулярна маса — 164 857.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENRPGSFQY		VPVQLQGGAP		WGFTLKGGLE		HCEPLTVSKI		EDGGKAALSQ
KMRTGDELVN		INGTPLYGSR		QEALILIKGS		FRILKLIVRR		RNAPVSRPHS
WHVAKLLEGC		PEAATTMHFP		SEAFSLSWHS		GCNTSDVCVQ		WCPLSRHCST
EKSSSIGSME		SLEQPGQATY		ESHLLPIDQN		MYPNQRDSAY		SSFSASSNAS
DCALSLRPEE		PASTDCIMQG		PGPTKAPSGR		PNVAETSGGS		RRTNGGHLTP
SSQMSSRPQE		GYQSGPAKAV		RGPPQPPVRR		DSLQASRAQL		LNGEQRRASE
PVVPLPQKEK		LSLEPVLPAR		NPNRFCCLSG		HDQVTSEGHQ		NCEFSQPPES
SQQGSEHLLM		QASTKAVGSP		KACDRASSVD		SNPLNEASAE		LAKASFGRPP
HLIGPTGHRH		SAPEQLLASH		LQHVHLDTRG		SKGMELPPVQ		DGHQWTLSPL
HSSHKGKKSP		CPPTGGTHDQ		SSKERKTRQV		DDRSLVLGHQ		SQSSPPHGEA
DGHPSEKGFL		DPNRTSRAAS		ELANQQPSAS		GSLVQQATDC		SSTTKAASGT
EAGEEGDSEP		KECSRMGGRR		SGGTRGRSIQ		NRRKSERFAT		NLRNEIQRRK
AQLQKSKGPL		SQLCDTKEPV		EETQEPPESP		PLTASNTSLL		SSCKKPPSPR
DKLFNKSMML		RARSSECLSQ		APESHESRTG		LEGRISPGQR		PGQSSLGLNT
WWKAPDPSSS		DPEKAHAHCG		VRGGHWRWSP		EHNSQPLVAA		AMEGPSNPGD
NKELKASTAQ		AGEDAILLPF		ADRRKFFEES		SKSLSTSHLP		GLTTHSNKTF
TQRPKPIDQN		FQPMSSSCRE		LRRHPMDQSY		HSADQPYHAT		DQSYHSMSPL
QSETPTYSEC		FASKGLENSM		CCKPLHCGDF		DYHRTCSYSC		SVQGALVHDP
CIYCSGEICP		ALLKRNMMPN		CYNCRCHHHQ		CIRCSVCYHN		PQHSALEDSS
LAPGNTWKPR		KLTVQEFPGD		KWNPITGNRK		TSQSGREMAH		SKTSFSWATP
FHPCLENPAL		DLSSYRAISS		LDLLGDFKHA		LKKSEETSVY		EEGSSLASMP
HPLRSRAFSE		SHISLAPQST		RAWGQHRREL		FSKGDETQSD		LLGARKKAFP
PPRPPPPNWE		KYRLFRAAQQ		QKQQQQQQKQ		QEEEEEEEEE		EEEEEEEEEE
EAEEEEEELP		PQYFSSETSG		SCALNPEEVL		EQPQPLSFGH		LEGSRQGSQS
VPAEQESFAL		HSSDFLPPIR		GHLGSQPEQA		QPPCYYGIGG		LWRTSGQEAT
ESAKQEFQHF		SPPSGAPGIP		TSYSAYYNIS		VAKAELLNKL		KDQPEMAEIG
LGEEEVDHEL		AQKKIQLIES		ISRKLSVLRE		AQRGLLEDIN		ANSALGEEVE
ANLKAVCKSN		EFEKYHLFVG		DLDKVVNLLL		SLSGRLARVE		NALNSIDSEA
NQEKLVLIEK		KQQLTGQLAD		AKELKEHVDR		REKLVFGMVS		RYLPQDQLQD
YQHFVKMKSA		LIIEQRELEE		KIKLGEEQLK		CLRESLLLGP		SNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dietz M.L., Bernaciak T.M., Vendetti F., Kielec J.M., Hildebrand J.D. (2006). Differential actin-dependent localization modulates the evolutionarily conserved activity of Shroom family proteins. J. Biol. Chem. 281: 20542—20554. PMID 16684770 DOI:10.1074/jbc.M512463200
• Barboza-Cerda M.C., Wong L.J., Martinez-de-Villarreal L.E., Zhang V.W., Dector M.A. (2014). A novel EBP c.224T>A mutation supports the existence of a male-specific disorder independent of CDPX2. Am. J. Med. Genet. A. 164A: 1642—1647. PMID 24700572 DOI:10.1002/ajmg.a.36508

Див. також

• Хромосома X