SIRT5

SIRT5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2B4Y, 2NYR, 3RIG, 3RIY, 4F4U, 4F56, 4G1C, 4HDA, 5BWL
Ідентифікатори
Символи	SIRT5, SIR2L5, sirtuin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604483 MGI: 1915596 HomoloGene: 40825 GeneCards: SIRT5
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • NAD+ binding • protein-succinyllysine desuccinylase activity • protein-malonyllysine demalonylase activity • zinc ion binding • NAD-dependent protein deacetylase activity • protein-glutaryllysine deglutarylase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальний міжмембранний простір • мітохондрія • клітинне ядро • гіалоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондріальна внутрішня мембрана Біологічний процес • protein deacetylation • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • response to nutrient levels • protein ADP-ribosylation • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • peptidyl-lysine deglutarylation • mitochondrion organization • regulation of ketone biosynthetic process • protein demalonylation • peptidyl-lysine demalonylation • protein desuccinylation • peptidyl-lysine desuccinylation • protein deglutarylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23408	68346
Ensembl	ENSG00000124523	ENSMUSG00000054021
UniProt	Q9NXA8	Q8K2C6
RefSeq (мРНК)	NM_001193267 NM_001242827 NM_012241 NM_031244	NM_178848
RefSeq (білок)	NP_001180196 NP_001229756 NP_036373 NP_112534 NP_001363727 NP_001363728 NP_001363729 NP_001363730 NP_001363731 NP_001363732 NP_001363733 NP_001363734 NP_001363735 NP_001363736 NP_001363737 NP_001363738 NP_001363739 NP_001363740 NP_001363741 NP_001363742 NP_001363743 NP_001363744	NP_849179
Локус (UCSC)	Хр. 6: 13.57 – 13.62 Mb	Хр. 13: 43.52 – 43.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIRT5 (англ. Sirtuin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 33 881.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPLQIVPSR		LISQLYCGLK		PPASTRNQIC		LKMARPSSSM		ADFRKFFAKA
KHIVIISGAG		VSAESGVPTF		RGAGGYWRKW		QAQDLATPLA		FAHNPSRVWE
FYHYRREVMG		SKEPNAGHRA		IAECETRLGK		QGRRVVVITQ		NIDELHRKAG
TKNLLEIHGS		LFKTRCTSCG		VVAENYKSPI		CPALSGKGAP		EPGTQDASIP
VEKLPRCEEA		GCGGLLRPHV		VWFGENLDPA		ILEEVDRELA		HCDLCLVVGT
SSVVYPAAMF		APQVAARGVP		VAEFNTETTP		ATNRFRFHFQ		GPCGTTLPEA
LACHENETVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

• Frye R.A. (1999). Characterization of five human cDNAs with homology to the yeast SIR2 gene: Sir2-like proteins (sirtuins) metabolize NAD and may have protein ADP-ribosyltransferase activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 273—279. PMID 10381378 DOI:10.1006/bbrc.1999.0897
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Michishita E., Park J.Y., Burneskis J.M., Barrett J.C., Horikawa I. (2005). Evolutionarily conserved and nonconserved cellular localizations and functions of human SIRT proteins. Mol. Biol. Cell. 16: 4623—4635. PMID 16079181 DOI:10.1091/mbc.E05-01-0033

Див. також

• Хромосома 6