SLFN14

SLFN14
Ідентифікатори
Символи	SLFN14, BDPLT20, schlafen family member 14
Зовнішні ІД	OMIM: 614958 MGI: 2684866 HomoloGene: 19082 GeneCards: SLFN14
Пов'язані генетичні захворювання
platelet-type bleeding disorder 20, rare hemorrhagic disorder due to a constitutional platelet anomaly
Онтологія гена Молекулярна функція • ribosome binding • ATP binding • endoribonuclease activity • nuclease activity • hydrolase activity • endonuclease activity • nucleotide binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • rRNA catabolic process • cellular response to magnesium ion • cellular response to manganese ion • mRNA catabolic process • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • platelet maturation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	342618	237890
Ensembl	ENSG00000236320	ENSMUSG00000082101
UniProt	P0C7P3	V9GXG1
RefSeq (мРНК)	NM_001129820	NM_001166028
RefSeq (білок)	NP_001123292	NP_001159500
Локус (UCSC)	Хр. 17: 35.54 – 35.56 Mb	Хр. 11: 83.17 – 83.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLFN14 (англ. Schlafen family member 14) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 912 амінокислот, а молекулярна маса — 103 907.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESLKTDTEM		PYPEVIVDVG		RVIFGEENRK		KMTNSCLKRS		ENSRIIRAIC
ALLNSGGGVI		KAEIDDKTYS		YQCHGLGQDL		ETSFQKLLPS		GSQKYLDYMQ
QGHNLLIFVK		SWSPDVFSLP		LRICSLRSNL		YRRDVTSAIN		LSASSALELL
REKGFRAQRG		RPRVKKLHPQ		QVLNRCIQEE		EDMRILASEF		FKKDKLMYKE
KLNFTESTHV		EFKRFTTKKV		IPRIKEMLPH		YVSAFANTQG		GYVLIGVDDK
SKEVVGCKWE		KVNPDLLKKE		IENCIEKLPT		FHFCCEKPKV		NFTTKILNVY
QKDVLDGYVC		VIQVEPFCCV		VFAEAPDSWI		MKDNSVTRLT		AEQWVVMMLD
TQSAPPSLVT		DYNSCLISSA		SSARKSPGYP		IKVHKFKEAL		QRHLFPVTQE
EVQFKPESLC		KKLFSDHKEL		EGLMKTLIHP		CSQGIVIFSR		SWAGDVGFRK
EQNVLCDALL		IAVNSPVVLY		TILIDPNWPG		GLEYARNTAH		QLKQKLQTVG
GYTGKVCIIP		RLIHLSSTQS		RPGEIPLRYP		RSYRLADEEE		MEDLLQALVV
VSLSSRSLLS		DQMGCEFFNL		LIMEQSQLLS		ESLQKTRELF		IYCFPGVRKT
ALAIKIMEKI		KDLFHCKPKE		ILYVCESDSL		KDFVTQQTTC		QAVTRKTFMQ
GEFLKIKHIV		MDETENFCSK		YGNWYMKAKN		ITHPKAKGTG		SENLHHGILW
LFLDPFQIHH		ADVNGLPPPS		AQFPRKTITS		GIHCALEIAK		VMKEEMKRIK
ENPPSNMSPD		TLALFSETAY		EEATCAQALP		GVCETKTNLT		TEQIANYVAR
KCHSLFQCGY		LPKDIAILCR		RGEDRGRYRL		ALLKAMELIE		THRPSEVVFS
PATGVWGSHI		VLDSIQQFSG		LERTVVFGLS		PECDQSEEFH		KLCFASRAIK
HLYLLYEKRA		AY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pisareva V.P., Muslimov I.A., Tcherepanov A., Pisarev A.V. (2015). Characterization of novel ribosome-associated endoribonuclease SLFN14 from rabbit reticulocytes. Biochemistry. 54: 3286—3301. PMID 25996083 DOI:10.1021/acs.biochem.5b00302

Див. також

• Хромосома 17