SLIT1

SLIT1
Ідентифікатори
Символи	SLIT1, MEGF4, SLIL1, SLIT-1, SLIT3, slit guidance ligand 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603742 MGI: 1315203 HomoloGene: 2302 GeneCards: SLIT1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • Roundabout binding • heparin binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • внутрішньоклітинний Біологічний процес • chemorepulsion involved in embryonic olfactory bulb interneuron precursor migration • диференціація клітин • neuron projection morphogenesis • dorsal/ventral axon guidance • negative chemotaxis • аксоноґенеза • negative regulation of synapse assembly • нейробіологія розвитку • telencephalon cell migration • multicellular organism development • forebrain morphogenesis • tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb • olfactory bulb development • motor neuron axon guidance • axon extension involved in axon guidance • retinal ganglion cell axon guidance • axon guidance • nuclear migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6585	20562
Ensembl	ENSG00000187122	ENSMUSG00000025020
UniProt	O75093	Q80TR4
RefSeq (мРНК)	NM_003061	NM_015748
RefSeq (білок)	NP_003052	NP_056563
Локус (UCSC)	Хр. 10: 97 – 97.19 Mb	Хр. 19: 41.59 – 41.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLIT1 (англ. Slit guidance ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 534 амінокислот, а молекулярна маса — 167 926.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALTPGWGSS		AGPVRPELWL		LLWAAAWRLG		ASACPALCTC		TGTTVDCHGT
GLQAIPKNIP		RNTERLELNG		NNITRIHKND		FAGLKQLRVL		QLMENQIGAV
ERGAFDDMKE		LERLRLNRNQ		LHMLPELLFQ		NNQALSRLDL		SENAIQAIPR
KAFRGATDLK		NLQLDKNQIS		CIEEGAFRAL		RGLEVLTLNN		NNITTIPVSS
FNHMPKLRTF		RLHSNHLFCD		CHLAWLSQWL		RQRPTIGLFT		QCSGPASLRG
LNVAEVQKSE		FSCSGQGEAG		RVPTCTLSSG		SCPAMCTCSN		GIVDCRGKGL
TAIPANLPET		MTEIRLELNG		IKSIPPGAFS		PYRKLRRIDL		SNNQIAEIAP
DAFQGLRSLN		SLVLYGNKIT		DLPRGVFGGL		YTLQLLLLNA		NKINCIRPDA
FQDLQNLSLL		SLYDNKIQSL		AKGTFTSLRA		IQTLHLAQNP		FICDCNLKWL
ADFLRTNPIE		TSGARCASPR		RLANKRIGQI		KSKKFRCSAK		EQYFIPGTED
YQLNSECNSD		VVCPHKCRCE		ANVVECSSLK		LTKIPERIPQ		STAELRLNNN
EISILEATGM		FKKLTHLKKI		NLSNNKVSEI		EDGAFEGAAS		VSELHLTANQ
LESIRSGMFR		GLDGLRTLML		RNNRISCIHN		DSFTGLRNVR		LLSLYDNQIT
TVSPGAFDTL		QSLSTLNLLA		NPFNCNCQLA		WLGGWLRKRK		IVTGNPRCQN
PDFLRQIPLQ		DVAFPDFRCE		EGQEEGGCLP		RPQCPQECAC		LDTVVRCSNK
HLRALPKGIP		KNVTELYLDG		NQFTLVPGQL		STFKYLQLVD		LSNNKISSLS
NSSFTNMSQL		TTLILSYNAL		QCIPPLAFQG		LRSLRLLSLH		GNDISTLQEG
IFADVTSLSH		LAIGANPLYC		DCHLRWLSSW		VKTGYKEPGI		ARCAGPQDME
GKLLLTTPAK		KFECQGPPTL		AVQAKCDLCL		SSPCQNQGTC		HNDPLEVYRC
ACPSGYKGRD		CEVSLDSCSS		GPCENGGTCH		AQEGEDAPFT		CSCPTGFEGP
TCGVNTDDCV		DHACANGGVC		VDGVGNYTCQ		CPLQYEGKAC		EQLVDLCSPD
LNPCQHEAQC		VGTPDGPRCE		CMPGYAGDNC		SENQDDCRDH		RCQNGAQCMD
EVNSYSCLCA		EGYSGQLCEI		PPHLPAPKSP		CEGTECQNGA		NCVDQGNRPV
CQCLPGFGGP		ECEKLLSVNF		VDRDTYLQFT		DLQNWPRANI		TLQVSTAEDN
GILLYNGDND		HIAVELYQGH		VRVSYDPGSY		PSSAIYSAET		INDGQFHTVE
LVAFDQMVNL		SIDGGSPMTM		DNFGKHYTLN		SEAPLYVGGM		PVDVNSAAFR
LWQILNGTGF		HGCIRNLYIN		NELQDFTKTQ		MKPGVVPGCE		PCRKLYCLHG
ICQPNATPGP		MCHCEAGWVG		LHCDQPADGP		CHGHKCVHGQ		CVPLDALSYS
CQCQDGYSGA		LCNQAGALAE		PCRGLQCLHG		HCQASGTKGA		HCVCDPGFSG
ELCEQESECR		GDPVRDFHQV		QRGYAICQTT		RPLSWVECRG		SCPGQGCCQG
LRLKRRKFTF		ECSDGTSFAE		EVEKPTKCGC		ALCA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Itoh A., Miyabayashi T., Ohno M., Sakano S. (1998). Cloning and expressions of three mammalian homologues of Drosophila slit suggest possible roles for Slit in the formation and maintenance of the nervous system. Brain Res. Mol. Brain Res. 62: 175—186. PMID 9813312 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00224-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wong K., Park H.T., Wu J.Y., Rao Y. (2002). Slit proteins: molecular guidance cues for cells ranging from neurons to leukocytes. Curr. Opin. Genet. Dev. 12: 583—591. PMID 12200164 DOI:10.1016/S0959-437X(02)00343-X
• Little M., Rumballe B., Georgas K., Yamada T., Teasdale R.D. (2002). Conserved modularity and potential for alternate splicing in mouse and human Slit genes. Int. J. Dev. Biol. 46: 385—391. PMID 12141424

Див. також

• Хромосома 10