SLITRK2

SLITRK2
Ідентифікатори
Символи	SLITRK2, CXorf2, SLITL1, SLIT and NTRK like family member 2, CXorf1, TMEM257
Зовнішні ІД	OMIM: 300561 MGI: 2679449 HomoloGene: 13054 GeneCards: SLITRK2
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84631	245450
Ensembl	ENSG00000185985	ENSMUSG00000036790
UniProt	Q9H156	Q810C0
RefSeq (мРНК)	NM_001144003 NM_001144004 NM_001144005 NM_001144006 NM_001144007 NM_001144008 NM_001144009 NM_001144010 NM_032539	NM_001161431 NM_198863
RefSeq (білок)	NP_001137475 NP_001137476 NP_001137477 NP_001137478 NP_001137480 NP_001137481 NP_001137482 NP_115928	NP_001154903 NP_942563
Локус (UCSC)	Хр. X: 145.82 – 145.83 Mb	Хр. X: 65.69 – 65.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLITRK2 (англ. SLIT and NTRK like family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 95 404.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSGVWFLSV		LTVAGILQTE		SRKTAKDICK		IRCLCEEKEN		VLNINCENKG
FTTVSLLQPP		QYRIYQLFLN		GNLLTRLYPN		EFVNYSNAVT		LHLGNNGLQE
IRTGAFSGLK		TLKRLHLNNN		KLEILREDTF		LGLESLEYLQ		ADYNYISAIE
AGAFSKLNKL		KVLILNDNLL		LSLPSNVFRF		VLLTHLDLRG		NRLKVMPFAG
VLEHIGGIME		IQLEENPWNC		TCDLLPLKAW		LDTITVFVGE		IVCETPFRLH
GKDVTQLTRQ		DLCPRKSASD		SSQRGSHADT		HVQRLSPTMN		PALNPTRAPK
ASRPPKMRNR		PTPRVTVSKD		RQSFGPIMVY		QTKSPVPLTC		PSSCVCTSQS
SDNGLNVNCQ		ERKFTNISDL		QPKPTSPKKL		YLTGNYLQTV		YKNDLLEYSS
LDLLHLGNNR		IAVIQEGAFT		NLTSLRRLYL		NGNYLEVLYP		SMFDGLQSLQ
YLYLEYNVIK		EIKPLTFDAL		INLQLLFLNN		NLLRSLPDNI		FGGTALTRLN
LRNNHFSHLP		VKGVLDQLPA		FIQIDLQENP		WDCTCDIMGL		KDWTEHANSP
VIINEVTCES		PAKHAGEILK		FLGREAICPD		SPNLSDGTVL		SMNHNTDTPR
SLSVSPSSYP		ELHTEVPLSV		LILGLLVVFI		LSVCFGAGLF		VFVLKRRKGV
PSVPRNTNNL		DVSSFQLQYG		SYNTETHDKT		DGHVYNYIPP		PVGQMCQNPI
YMQKEGDPVA		YYRNLQEFSY		SNLEEKKEEP		ATPAYTISAT		ELLEKQATPR
EPELLYQNIA		ERVKELPSAG		LVHYNFCTLP		KRQFAPSYES		RRQNQDRINK
TVLYGTPRKC		FVGQSKPNHP		LLQAKPQSEP		DYLEVLEKQT		AISQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue. Gene. 315: 87—94. PMID 14557068 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7
• Beaubien F., Raja R., Kennedy T.E., Fournier A.E., Cloutier J.F. (2016). Slitrk1 is localized to excitatory synapses and promotes their development. Sci. Rep. 6: 27343—27343. PMID 27273464 DOI:10.1038/srep27343

Див. також

• Хромосома X