SMPD2

SMPD2
Ідентифікатори
Символи	SMPD2, ISC1, NSMASE, NSMASE1, sphingomyelin phosphodiesterase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603498 MGI: 1278330 HomoloGene: 31129 GeneCards: SMPD2
Онтологія гена Молекулярна функція • sphingomyelin phosphodiesterase activity • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • caveola Біологічний процес • positive regulation of ceramide biosynthetic process • GO:0007243 intracellular signal transduction • lipid metabolism • ceramide biosynthetic process • response to mechanical stimulus • sphingomyelin metabolic process • sphingolipid metabolic process • sphingomyelin catabolic process • glycosphingolipid metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6610	20598
Ensembl	ENSG00000135587	ENSMUSG00000019822
UniProt	O60906	O70572
RefSeq (мРНК)	NM_003080	NM_009213
RefSeq (білок)	NP_003071	NP_033239
Локус (UCSC)	Хр. 6: 109.44 – 109.44 Mb	Хр. 10: 41.36 – 41.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMPD2 (англ. Sphingomyelin phosphodiesterase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот, а молекулярна маса — 47 646.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKPNFSLRLR		IFNLNCWGIP		YLSKHRADRM		RRLGDFLNQE		SFDLALLEEV
WSEQDFQYLR		QKLSPTYPAA		HHFRSGIIGS		GLCVFSKHPI		QELTQHIYTL
NGYPYMIHHG		DWFSGKAVGL		LVLHLSGMVL		NAYVTHLHAE		YNRQKDIYLA
HRVAQAWELA		QFIHHTSKKA		DVVLLCGDLN		MHPEDLGCCL		LKEWTGLHDA
YLETRDFKGS		EEGNTMVPKN		CYVSQQELKP		FPFGVRIDYV		LYKAVSGFYI
SCKSFETTTG		FDPHRGTPLS		DHEALMATLF		VRHSPPQQNP		SSTHGPAERS
PLMCVLKEAW		TELGLGMAQA		RWWATFASYV		IGLGLLLLAL		LCVLAAGGGA
GEAAILLWTP		SVGLVLWAGA		FYLFHVQEVN		GLYRAQAELQ		HVLGRAREAQ
DLGPEPQPAL		LLGQQEGDRT		KEQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як метаболізм ліпідів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

• Tomiuk S., Hofmann K., Nix M., Zumbansen M., Stoffel W. (1998). Cloned mammalian neutral sphingomyelinase: functions in sphingolipid signaling?. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 3638—3643. PMID 9520418 DOI:10.1073/pnas.95.7.3638
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sawai H., Domae N., Nagan N., Hannun Y.A. (1999). Function of the cloned putative neutral sphingomyelinase as lyso-platelet activating factor-phospholipase C. J. Biol. Chem. 274: 38131—38139. PMID 10608884 DOI:10.1074/jbc.274.53.38131

Див. також

• Хромосома 6